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要想分析好,三个门不能少

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发表于 2016-12-7 20:22:54 | 显示全部楼层 |阅读模式

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要使设门方法可靠,这中间的技巧还是很复杂的,首先就需要对目标细胞群的特点充分了解,并且排除掉一些干扰信号。 在论文中的图片,通常只讲述了部分,却把很多重要的门藏起来了。 所以为了实现多中心研究和提高可重复性,理解每个门的设置原因和特异性非常关键。

Maeker等人在《A modelfor harmonizing flow cytometry in clinical trials》(刊于Nat Immunol. 2010Nov;11(11):975-8. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20959798)中指出,因为数据分析导致的结果变异,每个实验室可高达20.5%,如果通过中心统一检测,可减少至4%。

当给新手培训数据分析时,需要告诉他们一些真正好用的设门经验,避免一些错误的观念,例如很多研究人员都习惯性一定要把FSC/SSC散点图作为第一个设门图,而实际上,需要事先排除掉粘连体、碎片、坐标边缘信号,并且建议最好用一个特异性标记选出目标细胞(例如用CD45/SSC设门选择淋巴细胞会比FSC/SSC更理想)。

今天就给大家介绍三个分析时不可缺少的门,这些门对于正确和良好的数据分析非常关键,可避免很多异常信号影响,尤其是目标细胞很稀有的时候。
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发表于 2016-12-8 21:17:04 | 显示全部楼层
在backman 的系统中如何设置排除门?
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 楼主| 发表于 2016-12-8 21:38:54 | 显示全部楼层
huananlou101 发表于 2016-12-8 21:17
在backman 的系统中如何设置排除门?

dump channel与机器无关,是多种系列特异性抗体混合而成。具体含义参见:http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-5074-1-1.html
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发表于 2016-12-10 10:25:01 来自手机 | 显示全部楼层
我想问,如果一份血样本,处理后胞内胞外都需要染色,但是隔2天才能上机,是处理好血样本后固定放置还是染色后再固定放置,还是什么其他的方式最好,隔2天会不会影响数据呢
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 楼主| 发表于 2016-12-10 14:08:27 来自手机 | 显示全部楼层
会开花的笔 发表于 2016-12-10 10:25
我想问,如果一份血样本,处理后胞内胞外都需要染色,但是隔2天才能上机,是处理好血样本后固定放置还是染 ...

为什么隔两天才能上机?一般还是需要先固定,你需要先看看多聚甲醛固定会不会影响你的抗原表达。

也可以考虑流式中文网出品的〖细胞保存液(临床和科研标本保存最佳搭档) 〗https://shop18622451.koudaitong.com/v2/showcase/goods?alias=270a60ykvgg6z&reft=1481349898510&spm=f45886504&oid=0
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发表于 2016-12-11 20:39:50 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-12-10 14:08
为什么隔两天才能上机?一般还是需要先固定,你需要先看看多聚甲醛固定会不会影响你的抗原表达。

也可以 ...

因为周末实验室流式机不开机……
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发表于 2016-12-11 20:41:32 | 显示全部楼层
老师,您好,我想问以下,如果有细胞内染色,(需要打孔,破膜),那么怎么区分死活细胞?PI是利用死细胞膜打开,应该用PI是不行的。不知道老师知道EMA吗?
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 楼主| 发表于 2016-12-12 12:16:28 | 显示全部楼层
张健 发表于 2016-12-11 20:41
老师,您好,我想问以下,如果有细胞内染色,(需要打孔,破膜),那么怎么区分死活细胞?PI是利用死细胞膜 ...

EMA应该不行,似乎也是通过渗透性鉴别的。

需要用胺类染料鉴别,live/dead系列中有一种适合fixable标本的死活染料可以。
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发表于 2019-1-29 22:26:55 来自手机 | 显示全部楼层
会开花的笔 发表于 2016-12-10 10:25
我想问,如果一份血样本,处理后胞内胞外都需要染色,但是隔2天才能上机,是处理好血样本后固定放置还是染 ...

我可以确定的说,不影响,一个样品我连续做过三天的分析,比例差异在3%之内。
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 楼主| 发表于 2019-1-30 21:57:22 | 显示全部楼层
qingshi 发表于 2019-1-29 22:26
我可以确定的说,不影响,一个样品我连续做过三天的分析,比例差异在3%之内。 ...

个别抗体会受固定影响的。
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