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逐级设门和逻辑设门,你更喜欢哪种?

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发表于 2017-2-17 20:50:27 | 显示全部楼层 |阅读模式

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流式细胞仪可以收集您感兴趣的事件,并且会把“看到”的每个事件都记录下来,包括碎片、缓冲液里面的杂质。 作为细胞学家,我们需要排除掉那些不需要的信号,保留我们需要的细胞信号,并选出我们感兴趣的细胞亚群。

设门方式主要有两种:逐级设门和逻辑设门。

当从样品中选择感兴趣的细胞时,可以选择逐级设门或逻辑设门,这取决于你使用的细胞仪和你要解决的问题。 老牌BD FACSCalibur上的Cell Quest和Cell Quest Pro软件擅长利用逻辑门,而BD Fortessa则使用逐级设门。

这两种设门方式之间有什么区别呢?

逐级设门
这是流式细胞仪和获取软件最常用的默认设门方式。这种设门方式是采用父级门和子级门,逐级向下设们,直到最后选出感兴趣的细胞。父门可以包含一个或多个子级门。

逻辑设门
逻辑这个词来自于19世纪数学家George Boole及其研究的逻辑几何学系统。逻辑设门允许门与门之间以AND、OR、NOT进行逻辑组合,对于选出同时表达抗原a、b、c的细胞特别有用。

逻辑设门在多色分选时很有用,例如用NOT门轻松排除掉不希望分选的细胞。在多色流式分析稀有细胞时,逻辑门配合逐级门也十分有用。

但是实际应用过程中,我们可以将逐级设门和逻辑设门组合起来用,以下图为例:
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发表于 2017-7-20 10:28:39 | 显示全部楼层
请教一下,如果是逻辑设门,是不是每个样品的阈值和增益都必须一样
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 楼主| 发表于 2017-7-20 16:41:19 | 显示全部楼层
小红子 发表于 2017-7-20 10:28
请教一下,如果是逻辑设门,是不是每个样品的阈值和增益都必须一样

为什么有这个说法??不过一般获取的时候,基本上都不会乱动这些条件的,即使微调了,对逻辑设门也不会有影响啊,只要你按照你预设的逻辑进行设门即可。
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