10色流式＋雷达图，完美呈现骨髓细胞分化

niwanmao

在过去二十年，流式细胞术（FC）免疫分型已发展成为血液肿瘤诊断、预后评估和疾病监测不可或缺的工具。 流式细胞仪硬件上的进展，使得我们现在可以检测越来越多的荧光，可以快速评估每秒数千个细胞的多个特征，从而为鉴别正常和低比例肿瘤细胞提供了越来越有利的条件，并且可评估不同细胞谱系的分化和成熟模式。
然而，数据分析的手段却落后于流式细胞仪进展的速度。目前的数据分析软件都只能最多呈现二维散点图，那么p个参数所需要的二维散点图的总数为[px(p-1)/2]，也就是说一个常规10色流式在即使不设门，可生成66个初始二维散点图，并且这个数量随着设门数增加而急剧增加。二维散点图提供的信息很有限，使得不同参数之间的信息分离，要获得细胞的完整表型信息，需要同时看完所有的散点图并且记住他们的表型关系。我深刻地记得，当时从4色流式一下子转换到10色流式，在数据分析上备受煎熬，一个病例有时候可以分析一整天。
在2017年3月3日的Cytometry B杂志上，Jafari K等人发表了一篇有趣的文章《Visualization ofcell composition and maturation in the bone marrow using 10-color flow cytometry and radar plots》，这篇文章倒也不是介绍什么颠覆性的分析方法，依然需要事先用二维散点图逐级设门圈出目的细胞，但是他们利用了Kaluza软件里面的雷达图呈现8维散点图，从8～9维方式显示了细胞分化成熟轨迹的分析，比较方便地肉眼区分正常人和MDS患者的骨髓，大家可参考一下。
方案
三管10色，见下表：


各管可区分的细胞、表型及其在雷达图上的颜色



正餐：分析
首先还是需要进行二维设门，圈出各类细胞。


第一步是三管共同设门需要的4个门：


管1的设门：


管2的设门：


管3的设门：


正常人骨髓的管1、管2和管3的雷达图呈现，观察红系、粒系、单核系的分化。


三例反应性骨髓增生的骨髓管1雷达图呈现，可见各系分化轨迹均无明显异常。


那么MDS会怎样？和正常人骨髓一对比，就很容易看出问题。
正常人的骨髓：


低原始细胞数的MDS患者骨髓：


应该说，雷达图对于多维参数的同时呈现比较有利，但是可能很多人看着容易乱，没关系，我也是：）但毕竟，这是一个有趣的试验。

saureus

太酷了！！！！！！！！！！！！！