在质谱仪中,用抗体标记的单细胞或携带高质量标签的其他探针在电感耦合等离子体中进行电离,每个细胞的离子通过飞行时间(TOF)质谱法测量。通过将抗体与携带镧系稳定同位素的金属螯合聚合物结合来实现高通量分析,收集的数据显示并分析与高参数流式细胞术相似。最初在2014年Giesen C, Wang HA, Schapiro D等人在Nat Methods 2014;11:417– 422.发表了《Highly multiplexed imaging of tumor tissues with subcellular resolution by mass cytometry,将新型激光消融装置引入质谱仪。固定在载玻片上的组织切片或细胞用抗体片和其他探针染色,并插入到消融室中,其中通过在213nm下操作的脉冲激光扫描组织并聚焦到1mm直径的斑点大小。在每个激光射击时,来自消除斑点的组织被蒸发,并且通过具有高时间保真度的惰性气体流携带到电感耦合等离子体离子源中,以通过质谱仪同时分析(图1)。