细胞周期flowjo拟合后各期总和小于100%

落花微雨

用BD C6测的细胞周期，后用flowjo处理的数据。照片中给出一个周期拟合图，图中G1、S和G2的总和是98.46，不是100%。我用flowjo拟合的周期各相之和总是小于100%，请问少的那1.54应该归于周期哪个阶段？

照片中给出所有组别周期各相所占百分比的柱状图，因为总和不是100%，而且各组距100%大小还不一样，请问这样的图片发文章能被接受吗？或者说，我可不可以把拟合缺失的那一点百分比归于周期某个相当中？

niwanmao

这是模型拟合的正常现象。不会有问题的，因为FlowJo软件是已经被公认的。

落花微雨

niwanmao 发表于 2018-3-7 16:51
这是模型拟合的正常现象。不会有问题的，因为FlowJo软件是已经被公认的。

好的，明白了，非常感谢老师

tiger

用ModFit分析就不会有这个问题。如仍用Flowjo分析的话，调整一下设门策略，尽量排除碎片和凋亡细胞，从这个样品看，几乎没有凋亡细胞。如果凋亡细胞很多的话，各期细胞之和会更离100更远。

落花微雨

tiger 发表于 2018-3-8 13:44
用ModFit分析就不会有这个问题。如仍用Flowjo分析的话，调整一下设门策略，尽量排除碎片和凋亡细胞，从这个 ...

多谢老师解答，也就是说周期之和少掉的那一小部分是凋亡细胞和碎片对吗？只可惜BD C6测得用不了modifit，好不容易发现flowjo可以分析。

tiger

落花微雨 发表于 2018-3-11 19:29
多谢老师解答，也就是说周期之和少掉的那一小部分是凋亡细胞和碎片对吗？只可惜BD C6测得用不了modifit， ...

我的理解应该是这样的。C6我不了解，你确定不能用ModFit分析？

落花微雨

tiger 发表于 2018-3-12 10:07
我的理解应该是这样的。C6我不了解，你确定不能用ModFit分析？

谢谢老师，这个问题我之前发帖询问过，下面是站长倪老师回复我的，因为兼容性不好所以用不了modifit。
C6要导出为FCS，但是即使是FCS，由于其坐标范围大，可能Modfit对其兼容性也不好。你可能只能采用FlowJo或艾森的NovoExpress软件了

tiger

落花微雨 发表于 2018-3-14 10:21
谢谢老师，这个问题我之前发帖询问过，下面是站长倪老师回复我的，因为兼容性不好所以用不了modifit。
C6 ...

你传一个C6的数据，我来试试，学习一下。

落花微雨

tiger 发表于 2018-3-14 12:42
你传一个C6的数据，我来试试，学习一下。

好的，老师。我导出一个FCS文件，压缩后传到附件里面了。

tiger

落花微雨 发表于 2018-3-16 09:39
好的，老师。我导出一个FCS文件，压缩后传到附件里面了。

C6不了解，但从你的样品参数来看，所有的周期分析参数都有，只是FL-2-A信号太弱，width更弱，几乎看不到。不知这两个参数凋高电压后会不会调出来。如果能调出来，就可以用ModFit了。供参考