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今天和大家分享一个我自己设计的AML MRD 的分析模板，软件用的是BC的KALUZA。设计思路很简单，就是用病人的确诊标本作为阳性参考，正常的meyloblast（取自儿童骨髓）作为阴性参考，随访标本夹在中间对比。Panel 是三管八色，都是临床常用的抗体。标本用的是英国实验室质控机构UKNEQAS的AML MRD 的质控标本，所以散点图看起来有点怪异， 但是RESIDUAL CELLS 还是很明显的。
1. 第一页第一行的三组图是给不同的标本标注颜色，以防万一新手忘记哪个颜色代表哪个标本；余下的就是一堆数据， 用了很多boolean gates。用来计算MRD的分母就是total events 减去 doublets 再减去细胞碎片。这页上面的一张图有点小错误，就是第一组数据的MRD 数被我不小心删掉了。。。
2. 第二页的设计思想是就是用设门的方法尽量去掉干扰因素， 比如细胞黏连和碎片，在这页中，绿色的图上（随访标本) 所有的门都是联动的， 以便节省在每个图上都要去整理一下的时间。紫色和蓝色图上门也是各自联动，紫色图的目的是为了把诊断标本的AML细胞圈出来给随诊的标本做参考，蓝色图是为了把正常的髓系原始细胞圈出来作为正常参考。
3. 第三，四和五页就是三管抗体对应的散点图了，这个可以自由发挥了。这几页图我也还是在思考怎么对比才能更有效的找到潜在的残存细胞。
现在很多争论围绕在用流式做AML MRD 对临床的指导价值。我个人认为基因诊断和流式在AML MRD的监测上是互补的。儿童AML MRD用流式监测的准确性会比用在成人患者上准确一些，因为儿童的AML 多为germline mutation, 成人多为somatic mutaion, 而且有的时候变异基因多达好几种，复发的大多都是对化疗药不敏感的克隆。但是流式的特点就是在相对准确的前提下能快速给出结果，所以对临床诊断治疗还是挺有帮助的。
（本来想截图贴在帖子里，但是总也贴不上，大家下载PDF对应看一下吧。这个模板还是草图，还在完善中）
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发表于 2018-7-26 21:15:24
发表于 2018-7-27 11:26:17
