在分析流式结果的遇到的问题，做的单标。

楚雪菡

我们做的是造血干细胞向红系谱系的分化，现在在原始的细胞中转入过表达的基因，选择了能够代表红细胞的一种膜表面分子进行检测，但是流式结果显示，这个变化是微小的，并不是有和无的关系，现在的问题是，我们想在作图的时候，能不能把这个变化更明显的表现出来，或者说是上流式的时候，有没有更好的一种方法，让这种变化更明显？现在的情况就是所有的峰图都在一个地方聚集。

niwanmao

这种逐渐偏移的变化，我觉得反而是更能够表示分化的演变。
你到时候做图，可以把这些散点图叠加在一起显示，就可以做出类似于我们临床上判断细胞是否异常的分化轨迹：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-5976-1-1.html

tiger

不要用百分数表示，用荧光强度表示，变化还是挺明显的

楚雪菡

tiger 发表于 2019-5-27 09:13
不要用百分数表示，用荧光强度表示，变化还是挺明显的

老师，您说的荧光强度是？具体是该怎么操作？不好意思，不太懂。

楚雪菡

niwanmao 发表于 2019-5-27 08:01
这种逐渐偏移的变化，我觉得反而是更能够表示分化的演变。
你到时候做图，可以把这些散点图叠加在一起显示 ...

嗯嗯，谢谢老师，那我用散点图的话，我昨晚又分析了一下，是不是只要通过FSC-SSC圈出一个门就好了？然后通过散点图叠加的方式看分化过程。

niwanmao

楚雪菡 发表于 2019-5-28 09:58
嗯嗯，谢谢老师，那我用散点图的话，我昨晚又分析了一下，是不是只要通过FSC-SSC圈出一个门就好了？然后 ...

看了下你的标题，做的是单标，这样就做不出分化轨迹来了，只能通过直方图的峰偏移来看

tiger

楚雪菡 发表于 2019-5-28 09:52
老师，您说的荧光强度是？具体是该怎么操作？不好意思，不太懂。

荧光强度就是常用的MFI，一定要用几何和中位数。从你的这几个样品看，CD235a的变化不是阳性率的差异，而是表达量的差异。CD235a分子的表达量，反应了红系细胞的分化程度，表达量越高，越成熟。

楚雪菡

tiger 发表于 2019-5-29 14:46
荧光强度就是常用的MFI，一定要用几何和中位数。从你的这几个样品看，CD235a的变化不是阳性率的差异，而 ...

还是不太明白，那我是否可以通过阳性率的差异来代表CD235a的变化呢？阳性率的差异不是也可以用来反映向红系的程度的不同？

楚雪菡

楚雪菡 发表于 2019-5-29 15:20
还是不太明白，那我是否可以通过阳性率的差异来代表CD235a的变化呢？阳性率的差异不是也可以用来反映向红 ...

那这个阳性率的变化差异我该怎么计算？

楚雪菡

niwanmao 发表于 2019-5-28 22:04
看了下你的标题，做的是单标，这样就做不出分化轨迹来了，只能通过直方图的峰偏移来看 ...

嗯，老师，我通过横坐标选择SSC，纵坐标选择CD235a，这样的方法做出来一个图，这样合理吗？