植物细胞的DNA倍体分析

crisezoe

各位老师：
     附件是在BD FACSAria II上做的植物细胞的细胞周期，用的是PI染色，我想问下这样的结果图形是否正确？因为植物细胞可能存在很多的倍体，所以PI用的是log，无法用modfit拟合。
    问题：1.倍体数的计算，假设P3是二倍体，P4的mean/P3的mean=2，那么P4是四倍体，以此类推，P5是八倍体，P6是十六倍体，是否就是这样计算的？
            2.标准品的选择，样品中是否还要加入标准品？植物细胞加什么样的标准品？


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niwanmao

1、2倍体、4倍体、8倍体等在线性模式下分布应该是这样的（见下图）：


而你由于是用LOG模式取的，所以几个峰是这样的（见下图），P4和P3之间、P5和P4之间因为采用了log，所以也难判断是不是成2倍关系。建议你最好还是用线性模式，否则分析的结果不可信。建议仔细读一下这本手册，我想应该会对你的实验有帮助（http://www.noble.org/MedicagoHandbook/pdf/FlowCytometry.pdf）：

2、动物细胞一般用鸡有核红细胞做倍体参照物。植物肯定也有相关的倍体描述，你可以使用正常的2倍体来做倍体参照物。

crisezoe

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    谢谢倪老师

landinsky

植物的细胞周期是不容易拟合出来的，很多植物的周期只能看到G1期的主峰和G2期的副峰，中间的S期几乎没有细胞，很难看到像动物一样的细胞周期图形。