T淋巴细胞分型流式数据处理

小哈happy哈

我第一次做提取荷瘤小鼠肿瘤组织及脾脏的T淋巴细胞，并用APC-CD3, PE-CD4和FITC-CD8抗体标记，我是在BD FACS Calibur仪器上测的，在仪器上我就调节了补偿，大概FL2-FL1 22%左右，图1是脾脏的T淋巴细胞圈门，然后是两个细胞分群的图，我发现左下象限的数据压轴很严重，我也不知道可以怎么在软件上调整，请各位老师帮忙指点一下。
图4是肿瘤细胞圈淋巴细胞的门，出来的结果（图5）就更丑了， 没有文献里细胞分群的图好看，不知道该怎么办了。
我是学材料的，第一次做淋巴细胞分群的实验，各位老师大家帮帮我吧

hwthwt

坐标轴改成Biexponential双指数显示

niwanmao

从细胞分布看，电压再调上去容易使阳性信号跑外面去，所以这样是可以的。
压轴，问题不大，是承认的。

小哈happy哈

niwanmao 发表于 2019-10-6 14:59
从细胞分布看，电压再调上去容易使阳性信号跑外面去，所以这样是可以的。
压轴，问题不大，是承认的。 ...

非常感谢老师的回复，还有一个问题想请教老师，我这个实验因为有补偿，一般是在上机的时候调补偿好呢，还是回来在Flow Jo上调补偿好呢，还是上机的时候调好补偿之后，在Flow Jo上还可以再调一下补偿呢，谢谢老师回答

niwanmao

小哈happy哈 发表于 2019-10-9 11:12
非常感谢老师的回复，还有一个问题想请教老师，我这个实验因为有补偿，一般是在上机的时候调补偿好呢，还 ...

可以拿回来再调补偿。
上机的时候关注阴性细胞位置即可，不要太高，也尽量不要压轴了。