流式表抗单标如何用FlowJo分析，结果应如何显示

小鹿

      各位老师好，最近在分析细胞流式表抗时遇到了一个问题，表抗是单标，荧光素连的是FITC.
      结果分析时是以不染抗体的NC设门，用柱状图显示的。然后显示各个组的阳性比率都差不多都是99.几，然后尝试看一下各组平均荧光强度代替，发现就是前面设门得出来的阳性比率高的平均荧光强度反而比较低，而且低很多？我的是算的single CELL的平均荧光强度，后来我求了一下FITC+的平均荧光强度，结果还是一样。。。


我想咨询一下前辈们平均荧光强度代表什么？他跟阳性比率是有关系吗？我应该算FITC+的平均荧光强度吗？表抗结果应该如何分析比较准确？

我刚刚入门学习流式，概念有一点模糊，想向各位老师请教一下。感谢感谢。

NC-设门

                          

实验组

niwanmao

百分率高不等于MFI高。这个概念一定要弄清楚。
百分率高，可以是呈均一的，也可以是弥散的。如果像你这里NC那样的均一而窄的峰，MFI可以高，但是弥散的话，MFI或许可以很低。
MFI，不需要你自己一个个算，是所以细胞计算几何平均值，软件里面内置这类统计数字。

如果百分率没有差异，那就考虑用MFI试试，但是细胞数量、抗体用量、仪器条件均需保持一致。

小鹿

niwanmao 发表于 2019-11-13 14:17
百分率高不等于MFI高。这个概念一定要弄清楚。
百分率高，可以是呈均一的，也可以是弥散的。如果像你这里NC ...

emmm,感谢老师的回帖。我是用flowjo里面计算的Geometric Mean。

那这样的话，有多少细胞表达表抗指标如何显示呢？我得出平均荧光强度能说明什么意义吗？

niwanmao

小鹿 发表于 2019-11-13 16:22
emmm,感谢老师的回帖。我是用flowjo里面计算的Geometric Mean。

那这样的话，有多少细胞表达表抗指标如 ...

平均荧光强度，本就是体现某群细胞的平均值，当然有意义。