查看: 170|回复: 8
收起左侧

[其它临床检测] 有没有较好的marker区分NK和CD8+ T?

[复制链接]
发表于 2020-3-12 18:56:23 | 显示全部楼层 |阅读模式
1流星
各位老师好,我想问问有没有较好的marker区分NK,NKT和CD8+ T。我更注重于测序检测的mRNA表达的marker,比如说单细胞marker,一些流式的marker用在这里效果不好。谢谢老师们。

发表于 2020-3-12 21:49:12 | 显示全部楼层
免疫学标记很简单啊。
CD8+T :CD3+CD56-CD4-CD8+
NK:CD3-CD56/CD16+
NKT:CD3+CD56+CD1d+
 楼主| 发表于 2020-3-17 16:39:18 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-3-12 21:49
免疫学标记很简单啊。
CD8+T :CD3+CD56-CD4-CD8+
NK:CD3-CD56/CD16+

老师,你好,我的细胞用聚类方法分为如图几类(这里没有展示CD4+的集群)并且提供了一些marker表达图,颜色越绿越亮代表高表达。
我之前用CD3标记时,具体有CD3G,CD3E和CD3D,发现用CD3E要比其他两个marker多标记更多细胞(如聚类图中的2),而其他两个marker表达很低,我不清楚这个算不算CD3+。并且这群细胞是FCGR3A(CD16)+CD1D-NCAM1(CD56)弱表达,如图所示。所以我不清楚它是哪种细胞类型。另外我在聚类图中的1中发现部分有CD4+NKG7+集群,实际上CD4+集群在更远端(这里没有展示),请问下是否有这种更像CD8 T细胞和NK细胞,而且也表达CD4+NKG7+CD8-的细胞群吗?
你的CD1d是不是CD1D呢?

谢谢老师。
cluster.png
cd3d.png
CD3E.png
cd3g.png
NCAM1.png
FCGR3A.png
nkg7.png
cd8a.png
CD4.png
发表于 2020-3-19 09:03:10 | 显示全部楼层
lh12565 发表于 2020-3-17 16:39
老师,你好,我的细胞用聚类方法分为如图几类(这里没有展示CD4+的集群)并且提供了一些marker表达图,颜 ...

你用的是质谱?还是常规流式?
如果是常规流式,是需要事先调节好补偿,才能拿去聚类的。
 楼主| 发表于 2020-3-19 10:16:41 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-3-19 09:03
你用的是质谱?还是常规流式?
如果是常规流式,是需要事先调节好补偿,才能拿去聚类的。 ...

老师,你好,我这个不是质谱和流式做的,是scRNA测序做的,我只是想知道有没有亚群表达CD4+NKG7+CD8A-且跟CD8 T细胞像的亚群。以及能够被CD3E高标记而被CD3G和CD3D弱标记且为NKG7+CD16+CD8A-CD4-的细胞亚群。因为我对PBMC细分类亚群了解不多,文献中目前没有找到这些表型,想看看有没有这些类型,谢谢老师
发表于 2020-3-19 10:33:45 | 显示全部楼层
lh12565 发表于 2020-3-19 10:16
老师,你好,我这个不是质谱和流式做的,是scRNA测序做的,我只是想知道有没有亚群表达CD4+NKG7+CD8A-且跟 ...

RNA测序结果,我无法评价,我们目前还是更相信流式的结果。
 楼主| 发表于 2020-3-19 10:52:21 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-3-19 10:33
RNA测序结果,我无法评价,我们目前还是更相信流式的结果。

好的,谢谢老师。我再问下NKT和γδT分别在PBMC中占比多少呢?
发表于 2020-3-19 11:18:29 | 显示全部楼层
lh12565 发表于 2020-3-19 10:52
好的,谢谢老师。我再问下NKT和γδT分别在PBMC中占比多少呢?

充分用好站内资源。
NKT:https://www.flowcyto.cn/bbs/thread-7330-1-1.html
γδT:6.40±0.77%(参考链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5494795/
 楼主| 发表于 2020-3-19 11:47:05 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-3-19 11:18
充分用好站内资源。
NKT:https://www.flowcyto.cn/bbs/thread-7330-1-1.html
γδT:6.40±0.77%(参考 ...

好的,谢谢老师
您需要登录后才可以回帖 登录 | 加入流式中文网

本版积分规则

手机版|流式中文网    

GMT+8, 2020-4-9 06:05

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2013 Comsenz Inc.