以Modfit分析细胞周期

xiaohulu

大家好！我最近在用modfit分析细胞周期，给药24h细胞周期变化不明显，所以给药48h后再测细胞周期。我的问题是：1. 48h时未给药细胞的细胞周期S期偏高，高至65.35%，请问这正常吗？

2. 细胞周期分为G0/G1, S, G2M, 三者之和为100%， sub-G0/G1相当于凋亡细胞，当勾选了apoptosis后，很多文献把sub-G0/G1（apoptosis）+G0/G1+ S+G2M作为细胞周期，但是和就大于100%了啊，请问小伙伴们是如何解决这个问题的呢？

niwanmao

比例之后，不一定是100%，这个问题很久之前就说过了，是正常现象，因为用模型拟合之后，并不是真实比例，投稿也是认同的。

PS ：提问，请选择相应的提问版块，切勿发到分享版块。这次先帮你转移过去，下不为例，为了论坛秩序，谢谢配合。

andygys

niwanmao 发表于 2020-4-26 12:52
比例之后，不一定是100%，这个问题很久之前就说过了，是正常现象，因为用模型拟合之后，并不是真实比例，投 ...

老师，请问下，用C6或CytoFLEX做细胞周期是不是都可以，有没有影响。用C6做周期后用modfit分析的时候发现Gate2中没有FL-W这个项，对分析周期有影响吗

niwanmao

andygys 发表于 2020-4-26 14:39
老师，请问下，用C6或CytoFLEX做细胞周期是不是都可以，有没有影响。用C6做周期后用modfit分析的时候发现 ...

C6获取的时候，本身就没有这个参数吧。
如果没有的话，可能会导致粘连体排除不了，会有影响的。

xiaohulu

niwanmao 发表于 2020-4-26 12:52
比例之后，不一定是100%，这个问题很久之前就说过了，是正常现象，因为用模型拟合之后，并不是真实比例，投 ...

好的，谢谢您的解答。正常组细胞周期S期偏高，高至65.35%，这正常吗？还是说我的细胞状态不好呢？

PS: 第一次发帖不太清楚，下次会注意的，谢谢提醒

niwanmao

xiaohulu 发表于 2020-4-26 15:17
好的，谢谢您的解答。正常组细胞周期S期偏高，高至65.35%，这正常吗？还是说我的细胞状态不好呢？

PS:  ...

你这里的粘连体设门是否有依据？有没有用倍体参照确定位置？这个位置设的有点随意。

xiaohulu

niwanmao 发表于 2020-4-26 16:06
你这里的粘连体设门是否有依据？有没有用倍体参照确定位置？这个位置设的有点随意。 ...

倪老师，细胞周期我用C6测的，没有W这个选项，这样的话怎么除粘连体呢？倍体参照怎么设置呢？

niwanmao

xiaohulu 发表于 2020-4-27 15:02
倪老师，细胞周期我用C6测的，没有W这个选项，这样的话怎么除粘连体呢？倍体参照怎么设置呢？ ...

如果这样的话，建议换别的机器做。倍体参照，就是用已知倍体的参照物，例如鸡红细胞（单倍体参照）、正常人全血的淋巴细胞（二倍体参照），加入样本中，确定峰的位置，才能正确分析未知倍体的倍性。

xiaohulu

niwanmao 发表于 2020-4-28 08:43
如果这样的话，建议换别的机器做。倍体参照，就是用已知倍体的参照物，例如鸡红细胞（单倍体参照）、正常 ...

好的，谢谢您的回复

闷油瓶

niwanmao 发表于 2020-4-28 08:43
如果这样的话，建议换别的机器做。倍体参照，就是用已知倍体的参照物，例如鸡红细胞（单倍体参照）、正常 ...

没有W，我看有A和H参数呀，不能以此来排除粘连体吗？