找回密码
 加入流式中文网

QQ登录

只需一步,快速开始

查看: 1633|回复: 12

[细胞因子检测] 怎么让每组细胞一样多

[复制链接]
发表于 2020-10-7 19:10:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
请问我要检测细胞膜蛋白表达情况,要多少个细胞合适。我现在是用7-AAD 区分出活细胞后,计数100000个活细胞为停止条件。请问这样可以吗?

然后,第一次我用flowjo圈第一个门选取细胞时已经改成dot plot 模式并且已经把显示细胞数改成100000,最后得到的结果不同组的细胞数并不同。第二次我改成圈出活细胞后改成 dot plot模式, 显示100000 个细胞,最后每组细胞还是不同。请问怎么才能让每组细胞数最后都一样呢?

最佳答案

查看完整内容

可以比较的。 要比较的话,选择Geomean或Median。前者用的相对比较多,后者适合非正态分布。 像你这个分布,有两个峰,我不明白为什么不用百分比?
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2020-10-7 19:10:56 | 显示全部楼层
chunfeng 发表于 2020-10-7 23:16
谢谢倪老师。如果每组细胞数不一样,我用MFI来比较蛋白表达的强弱可以吗?我这个组有两个峰,请问我可以 ...

可以比较的。
要比较的话,选择Geomean或Median。前者用的相对比较多,后者适合非正态分布。
像你这个分布,有两个峰,我不明白为什么不用百分比?
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2020-10-7 22:51:24 | 显示全部楼层
门内细胞获取数量是可以设置为一样的,不是设置显示数量,而是设置获取数量。不知道你是什么机型,可以参考机型配套软件的说明书。
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2020-10-7 23:16:30 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-10-7 22:51
门内细胞获取数量是可以设置为一样的,不是设置显示数量,而是设置获取数量。不知道你是什么机型,可以参考 ...

谢谢倪老师。如果每组细胞数不一样,我用MFI来比较蛋白表达的强弱可以吗?我这个组有两个峰,请问我可以直接在直方图上用flowjo自带的Σ功能里选mean算MFI吗
20UM.fcs_cells.png
20UM.fcs.png
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2020-10-9 02:11:25 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-10-8 15:57
可以比较的。
要比较的话,选择Geomean或Median。前者用的相对比较多,后者适合非正态分布。
像你这个分 ...

谢谢倪老师。因为其他组的图都是单峰,只有这个组有两个峰,所以我想用MFI来比较各组间的表达差异
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2020-10-9 03:44:43 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-10-8 15:57
可以比较的。
要比较的话,选择Geomean或Median。前者用的相对比较多,后者适合非正态分布。
像你这个分 ...

倪老师,请您帮忙看下,我检测细胞膜蛋白的表达。抗体APC标记,DNA 7aad染色区分死活细胞。请您看下我的整个分析步骤是否正确。谢谢了
新建 Microsoft Word 文档-1.jpg
新建 Microsoft Word 文档-3.jpg
新建 Microsoft Word 文档-2.jpg
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2020-10-9 15:05:11 | 显示全部楼层
chunfeng 发表于 2020-10-9 03:44
倪老师,请您帮忙看下,我检测细胞膜蛋白的表达。抗体APC标记,DNA 7aad染色区分死活细胞。请您看下我的 ...

形成这样的分叉,往往意味着数据出了问题。
这样用Geomean对比应该要出问题的。
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2020-10-16 22:17:37 | 显示全部楼层
本帖最后由 chunfeng 于 2020-10-16 22:19 编辑
niwanmao 发表于 2020-10-9 15:05
形成这样的分叉,往往意味着数据出了问题。
这样用Geomean对比应该要出问题的。 ...

谢谢倪老师。请问您说的分叉是指什么呢?出现这种问题的原因会是什么呢?不知道上面的分析步骤有没有什么错误?
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2020-10-17 09:50:35 | 显示全部楼层
chunfeng 发表于 2020-10-16 22:17
谢谢倪老师。请问您说的分叉是指什么呢?出现这种问题的原因会是什么呢?不知道上面的分析步骤有没有什么 ...

一般意味着有一个部分的信号是不正常的,大多数可通过排除粘连体、排除死细胞这两个步骤去除。
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2020-10-17 18:56:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 chunfeng 于 2020-10-17 19:22 编辑
niwanmao 发表于 2020-10-17 09:50
一般意味着有一个部分的信号是不正常的,大多数可通过排除粘连体、排除死细胞这两个步骤去除。 ...

感谢倪老师的耐心回答。我还是没能理解您说的“分叉”指的是什么情况。是指其他组都是单峰,只有20UM组有两个峰吗?最近一次的实验结果分析出来的20UM组也还是主峰前有一个小峰。如果方便,我可以把原始数据给您请您分析一下吗

最近一次20UM组处理结果

最近一次20UM组处理结果

处理步骤.zip

13.41 KB, 下载次数: 3

组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
您需要登录后才可以回帖 登录 | 加入流式中文网

本版积分规则 需要先绑定手机号

手机版|流式中文网 ( 浙ICP备17054466号-2 )

浙公网安备 33038202004217号

GMT+8, 2024-11-1 07:33

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表