最近在做外周血的流式,因为实验室之前没有做过,是自己建立摸索的方法,感觉有好多问题。先放在一个帖子里了,感觉比较容易看,如果不合适的话再重新发帖。先谢谢各位啦。
基本信息: 样品前处理方法: 预实验,所以小鼠没有经过其他处理。只是单笼饲养可能有轻微应激。 小鼠断尾取血100 μL,3000 rpm离心取血浆后(其他实验需要),5 mL RBC裂解红细胞5 min后等体积PBS中和,弃上清。沉淀以5% BSA PBS洗涤后,100 μL PBS重悬,CD16/32 抗体封闭15 min。洗涤后分两份(另一份染别的配色了),100 μL PBS体系染色20 min。洗涤上机。 抗体事先均经过滴定(但是只滴定了推荐浓度的0.5倍、1倍和1.5倍浓度,感觉差别不大,所以最后遵循了表达高的分子可以用低一点,表达不高的分子用推荐浓度这样的方法。) 配色方案如下: 图1(抗体选择) 分群设计如下: 图2(分群marker 设计)
问题: 1、配色和分群的设计有没有大的问题呢?我知道Th1和Th17用CXCR3和CCR6标记并不是最优的选择,但是这个细胞量做刺激和破膜不太现实。配色是自己配的,不知道有没有硬伤。 另外因为样品是100 μL的全血分了两份染,抗体浓度是按照推荐浓度来比较好呢,还是按照推荐浓度的一半比较好?滴定的分群没有特别明显的区别,但是考虑到染色体积还是100 μL,很多还是没有减半。不知道这个取舍怎么做比较好呢? 2、看FSC/SSC图,发现部分样品典型的粒细胞群似乎比较理论要少(印象中粒细胞应该是白细胞中最多的一部分?),请问这个情况是不是和我的样品前处理有很大的关系呢?怀疑是血液抗凝那一步的问题,但是不是特别确定。 图3(外周血FSC-SSC) 3、补偿调节是否合理? 在机器自动调节的补偿基础上又进行了微调。但是总有些对角线上的细胞调不下去。想要请教一下如何调节这部分补偿。 图4(补偿调节前后) 图5(补偿调节前后2) 图6(补偿调节后) 4、NK1.1阳性的细胞群中有一大部分是CD19阳性的。做了FMO看,这个补偿下NK1.1(PerCP-Cy5.5)应该是没有漏到CD19(SB645)的,但是反过来,CD19是有漏到NK1.1的。请问这个问题该如何解决呢?调节补偿可以解决吗?还是必须换配色才行? 如果换的话,考虑是去掉B220,加一个CD45的marker,刚好标一下白细胞,之后会更好分析。把CD45放在Percp-cy5.5,CD19在PECY5,Nkp46在655,这样即使CD19和Nkp46漏到CD45,因为本来它们也是CD45阳性的,对统计来说影响会小一点。不知道我这样考虑对不对? 图7(CD19-SB645FMO在CD19所在通道上) 图8(NK1.1-PerCP-cy5.5FMO在CD19所在通道上) 图9(CD19-SB645FMO在NK1.1所在通道上) 图10(NK1.1-PerCP-cy5.5FMO在NK1.1所在通道上) 4、CD25阳性比例低(左),甚至比未染色的阴性对照(右)还低。两图都是取的活细胞看的。不知道圈阳性门时是否应该按照未染色对照的阴性群来圈?(我的经验是染了色的阴性群往往比未染色的阴性群要高一些,所以如果这种情况下分群明显,就不会完全按照未染色的阴性来圈门;但是这里感觉未染色组的阳性很高,就不知道怎么圈了……)是不是补偿调节得不够好的原因呢?还是因为阴性群有自发荧光呢? 图11(样品CD25-CD127表达)
图12(未染色组CD25-CD127表达)
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