推荐一个多色补偿矩阵自动生成工具-AutoSpill

niwanmao

AutoSpill是一种对流式数据自动生成补偿矩阵的新颖方法。 AutoSpill结合了细胞群自动识别、基于线性回归的初始补偿矩阵计算和迭代优化以减少误差的功能，最终可产生了一个近乎完美的补偿矩阵，从而可以生成更高质量的数据。

AutoSpill也是使用单色补偿对照，与通用的下游流式细胞仪软件兼容，但是与当前可用的自动调节补偿方法在两个关键方面不同：
（1）对照的制备要求不高，因为它不需要存在分群非常好的阳性和阴性群体。
（2）不需要手动调整补偿矩阵。
（3）如果在数据集中存在空白通道，则可以计算并去除样品中的自发荧光。


使用说明：
1、访问https://autospill.vib.be/public/#/run
2、点击“Calculate Compensation”按钮，然后点击Browse，上传单染补偿FCS文件，可多个一起上传，最多100个文件，每个文件最大可50MB，然后提交
3、定义补偿参数：AutoSpill将自动检测并分配参数，但是可以修改这些参数。对于您添加的每个.fcs文件，确保已为其分配了正确的染料。
4、提交作业进行处理。这个过程可能会需要点时间，你可以记住Job ID，然后后续可回来根据Job ID查找运算结果。
5、在“Results”页面上，手动检查Gate和Spillover图。如果发现错误，则可以使用“re-adjust parameters”选项手动覆盖自动选择，例如细胞群选择。
6、完成后，将溢出矩阵下载为.mtx文件（可导入到FlowJo中）或下载为.csv文件（可导入到其他平台中）。

注：由于服务器是国外的，所以有时候可能需要翻出去。