流式数据分析问题

liailin00

我测得是MSC表面标记表达，需要分析marker的表达率（%），有做同型对照，遇到的问题与设门有关，因为阴性对照设门有很大的主观性，所以导致结果差异很大，请问阴性对照细胞设门的阳性率是在1%以内吗？阴性对照细胞设门的阳性率可以设到0%吗？

niwanmao

liailin00 发表于 2022-2-7 11:59
你好，请问我的这个散点图纵坐标应该是设SSC还是FSC？我看身边的人都设的不同。
...

不要紧，都可以的。

niwanmao

一般大概设在1％左右，但最关键的是看峰的位置。
我们做过MSC的那些标记，只要是MSC，相关标记都分得很开啊，不存在你所说的困扰。是不是你们的抗体滴度不达标？

liailin00

niwanmao 发表于 2022-2-6 17:28
一般大概设在1％左右，但最关键的是看峰的位置。
我们做过MSC的那些标记，只要是MSC，相关标记都分得很开啊 ...

您好，我培养的MSC的阳性标记还行，就是阴性标志不达标，我之前一直是用的直方图分析，但是后面由于工程师说用散点图画任意门会好点，我就换成散点图，但是分析的结果差距很大，因为我把阴性对照的阳性率设的很小，所以阴性标志结果是达标的，但是后面发现设门设错了，重新用直方图得到的结果就又不达标了。  请问您说的看峰的位置是怎么操作？

liailin00

niwanmao 发表于 2022-2-6 17:28
一般大概设在1％左右，但最关键的是看峰的位置。
我们做过MSC的那些标记，只要是MSC，相关标记都分得很开啊 ...

我抗体是用的BD的，2ul，没有做滴定。说明书推荐5ul。

liailin00

niwanmao 发表于 2022-2-6 17:28
一般大概设在1％左右，但最关键的是看峰的位置。
我们做过MSC的那些标记，只要是MSC，相关标记都分得很开啊 ...

同型对照

同型对照

同型对照

样品

样品

样品

PE是阴性标志。上面三张是ISO的，下面三张是样品的。

liailin00

niwanmao 发表于 2022-2-6 17:28
一般大概设在1％左右，但最关键的是看峰的位置。
我们做过MSC的那些标记，只要是MSC，相关标记都分得很开啊 ...

请问您说的看峰的位置是怎么操作？

niwanmao

liailin00 发表于 2022-2-6 19:51
PE是阴性标志。上面三张是ISO的，下面三张是样品的。

CD90不太好，先按全量再试试。
P8、P9、P10、P11的左边界你这里问题不太大，但如果我分析，我习惯将此边界再右移一点，就是根据峰的对称性来确认位置。

liailin00

niwanmao 发表于 2022-2-6 21:32
CD90不太好，先按全量再试试。
P8、P9、P10、P11的左边界你这里问题不太大，但如果我分析，我习惯将此边 ...

您说的是按说明书的5ul抗体染吗？那分析阴性marker的话怎么设界限门？我的阴性marker都是大于2%，但是国际标准是要小于2%。如果我把同型对照设到零点零几%就达标了，如果设到0.几就相差很大。

niwanmao

liailin00 发表于 2022-2-6 22:03
您说的是按说明书的5ul抗体染吗？那分析阴性marker的话怎么设界限门？我的阴性marker都是大于2%，但是国际 ...

阴性设在百分之多少，并无国际标准，而是文献常见的范围而已。
你上面的图不都是0.8％、0.9％吗？这可以啊，我的意思是根据我个人的习惯，根据此峰形的分布，可以再小一点。供参考。