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[流式相关软件] 关于双指数运算(Biexponential)的问题

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发表于 2013-8-23 11:44:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
在这里搜了下双指数的问题,只找到一篇。我们用BD Canto II,有双指数(Biexponential)的选项,我想知道在什么情况下该使用?以我目前的有限经验,感觉这个选项很好用,几乎总是使用。那为什么不设置成默认呢?换句话说,什么情况下不应该使用双指数?
另外,双指数的原理是什么?大概讲一下就可以,太详细也没用。
我搜到的之前说双指数的帖子说了,在双指数下不要调电压,但是我遇到过背景过高,双指数后电压需要下调的情况,这时还是需要调节吧?
谢谢大家不吝赐教!

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对数坐标不能显示负值数据,而双指数可以。至于原理和对数一样,只是函数不一样而已,双指数函数曲线在数值大的区间接近对数曲线,接近0的地方接近线性。 Diva的双指数是自动根据最小值算的,如果某些数据有个别细胞荧光强度特别低,整个图形就往右漂移,如果是Pattern Recognition分析结果会误导操作者。 在双指数下不要调电压是错误的说法! ...
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发表于 2013-8-23 11:44:21 | 显示全部楼层
对数坐标不能显示负值数据,而双指数可以。至于原理和对数一样,只是函数不一样而已,双指数函数曲线在数值大的区间接近对数曲线,接近0的地方接近线性。
Diva的双指数是自动根据最小值算的,如果某些数据有个别细胞荧光强度特别低,整个图形就往右漂移,如果是Pattern Recognition分析结果会误导操作者。
在双指数下不要调电压是错误的说法!
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发表于 2013-8-23 18:32:00 | 显示全部楼层

双指数是不是就是logicle?
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发表于 2013-8-23 19:20:29 | 显示全部楼层
查了下,双指数是logicle转换。原理应该是@haven_t 所说。至于为什么默认不设置为双指数,我试了几次logicle转换,觉得确实靠近0轴附近的变换特别大,对于一般的表达率检测可能问题不大,但是在临床上,识别一种细胞是否有问题,往往需要仔细区分其抗原表达的轨迹,例如S形、L型之类的(也就是@haven_t 这里所说的pattern recognition),如果经过logicle转换,可能会使这些形状发生改变,对我们判断这类细胞是否异常产生干扰。

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发表于 2013-8-25 16:44:48 | 显示全部楼层
正如二楼所说双指数的最大优点是能显示0以下数值,这样能使0以下数据不再压在坐标轴上,有利于画门操作。
至于为什么不设定为默认模式,我认为是因为不是所有的数据都有0以下数值,如FSC和SSC,还有在没有调节补偿的数据都不会出现0以下数值,
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发表于 2013-8-26 10:29:52 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-8-23 19:20
查了下,双指数是logicle转换。原理应该是@haven_t 所说。至于为什么默认不设置为双指数,我试了几次logicl ...

那是不是熟悉logicle转换后的形状,就不会对判断产生干扰了?,我想pattern recognition显示的抗原表达轨迹也是无数经验总结分析的结果吧
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发表于 2013-8-26 10:32:28 | 显示全部楼层
最近正好在学着用BD Canto II,也对Biexponential有这些疑问,这里太好了,得到指点了
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发表于 2013-8-26 10:36:07 | 显示全部楼层
samly0 发表于 2013-8-26 10:29
那是不是熟悉logicle转换后的形状,就不会对判断产生干扰了?,我想pattern recognition显示的抗原表 ...

呵呵,是有可能,但属于非主流吧:)
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发表于 2013-8-26 11:41:02 | 显示全部楼层
samly0 发表于 2013-8-26 10:29
那是不是熟悉logicle转换后的形状,就不会对判断产生干扰了?,我想pattern recognition显示的抗原表 ...

Diva的Biexponential是自动算出负值范围,坐标的基线随负值区漂移。所以如果标本有极少数细胞荧光强度特别低,阴性群体和弱阳性会被压缩,视觉上群体的分布就改变了。当然Diva可以固定负值区,增加图形的可比性。

点评

非常感谢,这些资料对我很有帮助: 5.0
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  发表于 2013-8-26 15:43
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 楼主| 发表于 2013-9-29 11:07:56 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-8-23 19:20
查了下,双指数是logicle转换。原理应该是@haven_t 所说。至于为什么默认不设置为双指数,我试了几次logicl ...

谢谢倪老师,我们是做试剂的,对于临床的应用真不是精通,谢谢您指点。
关于pattern recognition,我可以举出的例子就是CD11b,双峰头。但是这些不是都应该建立在阳性区域的表达上么?什么样的峰型也得让它出现在阳性区吧?而且这些我们熟悉的峰型也应该是对数坐标才出现的吧?
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