flowjo处理数据

shazhi0507 · 发表于 2013-9-12 19:53:31

最近做流式需要自己调整数据，但是用flowjo处理fcs数据时，不知道怎么显示荧光值，比如all或者P1的FITC-mean，
请求大神指导……

niwanmao · 发表于 2013-9-12 20:07:11

见下图，按照顺序操作即可（此处以geomean为例）。
如果要显示某个门内的geomean，可以单击右上的向下三角形，打开该门内细胞，然后再使用同样操作。

niwanmao · 发表于 2013-9-12 22:19:30

shazhi0507 发表于 2013-9-12 22:17

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新人好像发不了图片……囧

直接点击回复时，弹出的浮动窗口是快速回复，无法上传图片，必须点击右上方“高级模式”切换到高级模式编辑器上传。

shazhi0507 · 发表于 2013-9-12 22:39:10

niwanmao 发表于 2013-9-12 22:19

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直接点击回复时，弹出的浮动窗口是快速回复，无法上传图片，必须点击右上方“高级模式”切换到高级模式编 ...

好的了解了，这是我原始数据的作图，和flowjo处理后根据FITC-A mean算得的作图，后两个点差异蛮大的……

niwanmao · 发表于 2013-9-12 22:47:38

shazhi0507 发表于 2013-9-12 22:39

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好的了解了，这是我原始数据的作图，和flowjo处理后根据FITC-A mean算得的作图，后两个点差异蛮大的……
...

没看懂什么意思？原数据是什么数据？

shazhi0507 · 发表于 2013-9-13 09:18:07

niwanmao 发表于 2013-9-12 22:47

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没看懂什么意思？原数据是什么数据？

是流式检测后直接输出到PDF中的数据，未经flowjo调整

niwanmao · 发表于 2013-9-13 12:40:13

shazhi0507 发表于 2013-09-13 09:18:07

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是流式检测后直接输出到PDF中的数据，未经flowjo调整

直接输出是用什么软件？flowjo中调整过，调整了什么？此外，你这个曲线图的纵坐标究竟代表什么？

shazhi0507 · 发表于 2013-9-13 13:49:11

niwanmao 发表于 2013-9-13 12:40

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直接输出是用什么软件？flowjo中调整过，调整了什么？此外，你这个曲线图的纵坐标究竟代表什么？ ...

直接输出是用BD的FACSDiva软件，用flowjo调整了细胞门的位置。
得到的数据即FITC荧光值，在实验组中扣除本底（对照），以最大值为100%计算各时间点的相对荧光强度，
纵坐标代表在各时间点MGC803细胞的药物相对摄取量。

我觉得处理后得到的曲线会有一些变动，但没想到有这么大的变动……

niwanmao · 发表于 2013-9-13 16:36:21

shazhi0507 发表于 2013-9-13 13:49

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直接输出是用BD的FACSDiva软件，用flowjo调整了细胞门的位置。
得到的数据即FITC荧光值，在实验组中扣除 ...

调整了细胞门的位置，结果当然会发生改变。这很正常啊。如果你要对比，我觉得肯定要在同一个软件里面对比。

shazhi0507 · 发表于 2013-9-13 17:31:31

niwanmao 发表于 2013-9-13 16:36

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调整了细胞门的位置，结果当然会发生改变。这很正常啊。如果你要对比，我觉得肯定要在同一个软件里面对比 ...

恩好的，一个成功的流式果然不是那么容易的……
谢谢大神!

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