flowjo收获的细胞很多，怎么让只显示1万个细胞？

bluelightzjz

如题

niwanmao

设置flowjo显示细胞数其实很简单，只是由于我们平时都是用pesudocolor图，该类型的图片没有相关设置选项，所以都以为没有。其实如果把graph type改为dot plot（如下图），其右侧就会出现一个Num. Data设置项，输入你要显示的细胞数量即可。

设置flowjo显示数量

EthanMr

niwanmao 发表于 2013-10-29 08:53

                               
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设置flowjo显示细胞数其实很简单，只是由于我们平时都是用pesudocolor图，该类型的图片没有相关设置选项， ...

求问细胞周期分析的软件有没有类似的功能？Modifit、FCS Express 好像都没有这个功能呢。或者有没有相应的软件可以将我收的3万细胞的“.fcs”文件导出其中1万细胞，然后再进行分析？

niwanmao

EthanMr 发表于 2013-10-29 10:57

                               
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求问细胞周期分析的软件有没有类似的功能？Modifit、FCS Express 好像都没有这个功能呢。或者有没有相应的 ...

flowjo或者diva软件可以导出FCS文件中指定数量的事件，另存为新的FCS文件，你可以用这种导出的FCS文件再在细胞周期分析软件中分析。

不过，这里得提一句，细胞周期分析反而应该用3万个更好。

月下听蝉

niwanmao 发表于 2013-10-29 11:37

                               
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flowjo或者diva软件可以导出FCS文件中指定数量的事件，另存为新的FCS文件，你可以用这种导出的FCS文件再 ...

想问下倪老师，在用流式进行细胞计数，有需要注意的事情吗？特别是数微量细胞（10^5水平）
比如上样体积、流速控制等。

niwanmao

月下听蝉 发表于 2013-10-29 15:51

                               
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想问下倪老师，在用流式进行细胞计数，有需要注意的事情吗？特别是数微量细胞（10^5水平）
比如上样体积 ...

我们平时就做MRD时取过10万个细胞。上样体积、流式控制应该要求不高，不过老实说，在CANTO II上我曾发现慢速比高速要稳定很多，所以如果时间充足，慢速优选。

月下听蝉

niwanmao 发表于 2013-10-29 18:53

                               
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我们平时就做MRD时取过10万个细胞。上样体积、流式控制应该要求不高，不过老实说，在CANTO II上我曾发现 ...

我用AriaIII，配5激光，用的时候需要四激光四色来定位微量细胞，有时候细胞会少到10^3水平，但细胞总数会很多。就不知液流过快会不会对荧光的判读有影响，但太慢就要上样很久，经常得数3h以上。。

niwanmao

月下听蝉 发表于 2013-10-29 20:08

                               
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我用AriaIII，配5激光，用的时候需要四激光四色来定位微量细胞，有时候细胞会少到10^3水平，但细胞总数会 ...

我个人的感觉，速度越快，其CV值肯定要受到影响，所以只要细胞密度足够，我个人倾向用慢速。你可以试试减少上样体积（例如控制在300ul左右），这样细胞密度就比较高，在低速也能很快获取到目标数量的细胞。

月下听蝉

niwanmao 发表于 2013-10-29 20:11

                               
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我个人的感觉，速度越快，其CV值肯定要受到影响，所以只要细胞密度足够，我个人倾向用慢速。你可以试试减 ...

好的，多谢！

EthanMr

niwanmao 发表于 2013-10-29 11:37

                               
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flowjo或者diva软件可以导出FCS文件中指定数量的事件，另存为新的FCS文件，你可以用这种导出的FCS文件再 ...

多谢倪老师。我也知道周期分析细胞多一些更好，但是在用Modifit分析的时候发现，收3万个细胞的话，多数分析结果的RCS值大于5%，收2万个细胞的话分析起来就会好一些。