FCS Express怎么作出的这种color dot？

钢蛋儿 · 发表于 2014-2-15 22:44:56

经过多步骤的设门，成了类似等高图的彩图，从里向外有颜色过渡，很好看。能确定这张图使用FCS Express做的。我做完之后的color dot却是一团乱……

niwanmao · 发表于 2014-2-15 22:44:57

flowjo和ACEA NovoExpress软件都很方便做出这种图。不过FCS Express我以前用的旧版本似乎没看到，刚才找了下它们网站的资料，发现可能可以通过调节颜色做出来。

请参考：
http://www.denovosoftware.com/site/manual/inserting_a_2d_plot.htm
http://www.denovosoftware.com/si ... ityplotsforV4.shtml

chymanhz · 发表于 2014-2-16 10:18:00

果然怪异啊

钢蛋儿 · 发表于 2014-2-16 10:29:39

本帖最后由钢蛋儿于 2014-2-16 10:37 编辑

chymanhz 发表于 2014-2-16 10:18
果然怪异啊

具体文章在plos one，是我们实验室毕业的一个师兄写的文章，他用的是 FCS Epress 4 software，因为不方便与他联系所以就来论坛里面讨论下……
http://www.plosone.org/article/i ... ournal.pone.0031710

钢蛋儿 · 发表于 2014-2-16 12:11:32

niwanmao 发表于 2014-2-16 11:44
flowjo和ACEA NovoExpress软件都很方便做出这种图。不过FCS Express我以前用的旧版本似乎没看到，刚才找了 ...

谢谢倪老师！困扰我已久的问题被您一语道破……真是惭愧
该图乍一看是color dot图，其实是Density图……然后在Format中把overlays上的show outliers 打勾就行了。还可以调节outliers的颜色。再次感谢O(∩_∩)O~

haven_t · 发表于 2014-2-16 19:15:17

钢蛋儿发表于 2014-2-16 12:11
谢谢倪老师！困扰我已久的问题被您一语道破……真是惭愧
该图乍一看是color dot图，其实是Density图…… ...

为什么图里面隐约看到小格子？在细胞密度中等的地方比较明显，Kaluza也有这个现象，不知道这图形是怎么处理的？

niwanmao · 发表于 2014-2-16 20:59:53

haven_t 发表于 2014-2-16 19:15
为什么图里面隐约看到小格子？在细胞密度中等的地方比较明显，Kaluza也有这个现象，不知道这图形是怎么处 ...

视觉误差吧？我似乎看不出来嘛

haven_t · 发表于 2014-2-16 21:17:43

本帖最后由 haven_t 于 2014-2-16 21:19 编辑

图中间FSC几个字下面的那群细胞比较明显，仔细看看会发现，很有规律，不是数据的问题，是图像处理造成的。我圈了其中一个格子，仔细看看旁边就觉得很明显象地砖的感觉。

chymanhz · 发表于 2014-2-17 08:28:14

haven_t 发表于 2014-2-16 21:17
图中间FSC几个字下面的那群细胞比较明显，仔细看看会发现，很有规律，不是数据的问题，是图像处理造成的。 ...

我也是觉得这个地方有点怪异，应该是算法的问题吧

钢蛋儿 · 发表于 2014-2-17 13:32:41

果然是有很多网格哎～

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