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彩云之南,线下聚会热闹非凡,是谁掀起了现场风暴?

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发表于 2019-5-12 21:49:52 | 显示全部楼层 |阅读模式

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昆明,一座四季如春、花团锦簇的春城。不过在5月11日,似乎是为了配合我们第17次流式中文网线下聚会的热度,最高气温飙升至34度。 昆明的FLOWER们非常守时,在9:30聚会开始前10分钟,就几乎全到齐了,这素质不同一般。
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人到齐,那么我们就依然同历次聚会一般,开始大家自我介绍,互相认识。从前面这么多次的经验来看,这个方法虽然看起来很老土,但不失为一个认识新朋友、找到新亮点的机会,而且在自我介绍的时候,不知不觉减轻大家的生疏感。
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自我介绍完,就毫不拖泥带水地进入知识分享。首先上场的是我们昆明附一的武坤老师,他给我们介绍了流式的临床应用,从淋巴亚群到免疫分型,从MRD到HLA-B27,从PNH到CD34干祖细胞检测,做了一个提纲挈领式的介绍和概览。
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接着赵仁彬老师给我们带来了一场精彩的细胞因子在临床的应用,从细胞因子的概念、作用,到临床上血液病上的应用,再到一些Elaffin、REG-3a、sT2等因子在移植物抗宿主病的的应用,展示了他们珍贵的一些数据和结果,其科研思维甚为缜密。
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略作中场休息之后,重庆三医的杨再林老师则接着武坤老师的概览,给我们深入介绍了精细淋巴亚群在临床感染科、生殖科、ICU、消化科、呼吸科、风湿免疫科等科室的应用,思维清晰、案例典型,从数十张的PPT中可以看出其务实能干。
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由于内容太精彩,不知不觉临近12点了,我连忙上场解答报名时征集到的两个小问题,问题不复杂,但是交流一下还是有必要的。
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其中对于赵仁彬老师询问的光谱流式,请到了Cytek技术经理孙燕霞给大家详细讲解了光谱流式的原理和应用案例。
分享的时间过得太快,赶紧去合个影吧,这也是每次聚会的惯例,不留念,如何回忆呢?
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于是饭点被压缩到半个多小时。匆匆忙忙吃完中饭,赶紧回到聚会现场,开始下午的重头戏——『流式智子』内测首发。
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关于流式智子,有必要做个简介,这是一个最终目标是让所有的流式分析都能自动化、让流式分析脱离人为误差的网站式应用(虽然目前只是迈出了第一步:快速降维和自动分群),也是我8年以来两次爽约的补偿。其特色是:
  • 更快速的降维算法:10色数据10万个事件在3分钟以内完成。(目前流式行的t-SNE大多只能降维5000,在某些经过优化的专业软件中能处理5万,但速度极慢,容易死机)
  • 更符合实际的基于降维后密度的分群算法,从临床分析角度优于目前广泛被各大商业软件采用的FlowSOM算法。
  • 三步完成分析(勾选参数、补偿调节、自动降维&自动分群),每一步尽可能采用大量自动处理,减少人工参与
  • 细胞群快速命名
  • 同名细胞自动合并
  • 展示去除碎片、噪音后的最终多色结果

任何事物都有缺点,所以我们需要正视它,目前流式智子的缺点是:
  • 目前只能以单线程运行,不影响结果,但同时访问的用户互相可能会因为计算资源的争抢存在停顿。
  • 不能自动判断细胞性质。
  • 为减少此类停顿,对上传的文件大小限制在10MB,以避免计算资源长时间占用。经验:一般4~5万个事件、10色流式数据大小在3兆左右
  • 只能分出群体比例,不能设十字门和按照十字门计算某个抗原表达率。

这些缺点,会在内测期间至今年年底前,逐步解决大部分,让流式智子从出生变成能走能跑的小娃娃。 现场,我们进行了流式智子五个内测名额的抽奖,五位幸运FLOWER获得了内测名额,希望他们能给我们更多更好的反馈。
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下面看其中第一步的操作小动画(一共只需三步就能完成自动分群),实例分析视频、聚会的内容分享都会在本周陆续选择发布。
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话说这么一个高效的系统,是不是要卖得很贵?错了,免费!免费!免费!研发的初衷之一,就是看到太多FLOWER在找盗版软件,还要到处问软件怎么使用,所以在内测完成之后,流式中文网会对所有注册会员不定期分批发放“智码”兑换(一种登录流式智子的特殊密码),一颗流星兑换一天使用期限(要知道,你每天登录一次流式中文网论坛,就能得到一颗流星奖励哦,这等于说无限期免费)。
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发表于 2019-5-13 15:55:30 | 显示全部楼层
期待智子AI哈哈
发表于 2019-5-13 23:17:33 | 显示全部楼层
期待智子早日发布稳定版
发表于 2019-5-15 17:07:50 | 显示全部楼层
倪老师和开发的老师们厉害了,期待。
 楼主| 发表于 2019-5-15 18:40:44 | 显示全部楼层
我想成大牛 发表于 2019-5-15 17:07
倪老师和开发的老师们厉害了,期待。

我独自开发的
发表于 2019-5-16 09:16:27 | 显示全部楼层

五体投地,拜服。
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