到底取哪个中位数来判断MFI强弱

niwanmao

你没搞清楚概念，请参见：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2189-1-1.html

niwanmao

有中有为 发表于 2013-8-30 00:12

                               
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不是说在LOG状态下，非正态分布时，取中位数来判断MFI是比较好的一个指标嘛 ...

应该这么理解：当你要分析的峰呈正态分布时，log坐标，此时geomean和median基本重叠，可以用任何一个，当然我个人觉得geomean更好；当你要分析的峰呈非正态分布时，log坐标，此时建议用median。
从你的图上看，你的R7为什么不设在下图中的红色箭头处呢？如果设在红色箭头处，阳性峰应该基本上正态分布，可以用geomean，也可以用median，两者数值比较接近。

niwanmao

有中有为 发表于 2013-8-30 09:33

                               
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这个R7门是根据阴性对照设的，像比较平行组之间的MFI是不是不要用这个R7门，而直接用R1所做出来的104.62 ...

是阴性对照还是同型对照？

niwanmao

有中有为 发表于 2013-8-30 10:09

                               
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设这个R7门之前是想比较阳性率，但是结果出的大部分是95%以上，所以我现在想用中位数来进行MFI比较，那中 ...

你测的标本是什么？为什么FSC这么小？碎片难以排除吧

niwanmao

有中有为 发表于 2013-8-30 10:51

                               
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这张图片测的是组织里的，我后面还有细胞的，阳性率也有这么高，是直接取R1的就可以了吧， ...

你的FSC太小了，我觉得是碎片居多，故FL1结果中阴性部分可能大部分都是碎片，结果不可信。建议重复一下实验。

通过你这两个图形，我推测：如果FSC好的话，R1内的细胞FL1表达分布应该是单峰，是可以直接取R1的。