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楼主: bluefishcyl

[凋亡检测] 3色凋亡

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 楼主| 发表于 2012-3-23 22:07:50 | 显示全部楼层
不是很会用flowjo
DATA01:阴性
DATA02:转染EGFP单染,怎么会是一条斜线?全部调下来会压线,忘记截图补偿之前的啦!
DATA03:阴性无EGFP,单染AV-PE 感觉PE没有染上,是不是没有凋亡的细胞?
DATA04:阴性无EGFP,单染7aad
DATA05:阴性无EGFP,双染AV-PE和7aad
DATA06:转染EGFP,双染AV-PE和7aad

求真相!!

3-colour-Batch-1.pdf

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发表于 2012-3-24 10:20:32 | 显示全部楼层

总体的感觉,大约20-30%的细胞死亡。
这些明显的非特异性染色(就是下图中的斜线)没法调下来的,你可以在分析软件中看看,肯定是来源于FSC-SSC图中最左侧FSC最小的那堆碎片/死细胞。
2012-03-24_101615.png

第二个问题,我觉得从上图和下图中都看的出来,AV-PE(即FL2)的电压调的太低了,建议可以调高一些。重要的是,调节的时候可以只看下图FSC-SSC点图中我画的红圈中那堆状态较好的细胞,其它细胞暂时不管。
2012-03-24_101011.png

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 楼主| 发表于 2012-3-24 13:04:59 | 显示全部楼层
我把egfp单染的门右移了下,右上象限还是有细胞,是不是因为荧光太强了?EGFP电压再调小也移过来,PE电压大了不就下不来了么?
另外,我用空白阴性,没有明显的两群细胞,怎么办?
egfp.jpg
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发表于 2012-3-24 13:59:10 | 显示全部楼层
bluefishcyl 发表于 2012-3-24 13:04
我把egfp单染的门右移了下,右上象限还是有细胞,是不是因为荧光太强了?EGFP电压再调小也移过来,PE电压大 ...

你的细胞有没有用什么药物处理过?
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 楼主| 发表于 2012-3-24 15:12:57 | 显示全部楼层
没有哦!
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发表于 2012-3-24 21:10:07 | 显示全部楼层

从data.005和data.006来看,转染egfp和不转染的细胞,其FL1的阴性区域也还是相差比较大的(见下图)。所以,到时候设置十字门的时候还是以下面转染egfp这管为准吧,补偿调节的还可以,只是AV-PE的电压建议稍微增高一点。如果设门改变了那个拖尾仍存在,那我觉得没有办法消除了,我只能说很可能跟细胞状态有关,镜下看过细胞状态没有?




2012-03-24_205809.png


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 楼主| 发表于 2012-3-25 13:50:28 | 显示全部楼层
看过,转染的细胞状态很好,我是对照质粒,荧光很强很多。如果我的空白阴性没有明显的两群,是不是可以用后面的来画门?你需要我的原始数据帮我看看么?谢谢!
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发表于 2012-3-25 14:52:51 | 显示全部楼层
bluefishcyl 发表于 2012-3-25 13:50
看过,转染的细胞状态很好,我是对照质粒,荧光很强很多。如果我的空白阴性没有明显的两群,是不是可以用后 ...

原始数据传上来看看吧。我在想,是不是有可能是因为荧光远远超出检测最高限,从而形成拖尾。
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 楼主| 发表于 2012-3-25 15:53:51 | 显示全部楼层
我也觉得是荧光太强

RAW DATA.zip

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