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楼主: shinian

[淋巴细胞相关] 请教多重染色时的补偿调整问题

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发表于 2016-3-21 17:57:59 | 显示全部楼层
从图上看,看不到阴性群。调补偿应该是,同一群细胞,有阳性的,有阴性的;根据阴性的,把阳性PE溢漏到PERCP-cy5.5的信号给调下来。CIK的话,CD8PE肯定有阴性的,你要不把X轴Y轴调出来看看,看阴性细胞和阳性细胞重心是否在同一水平线。
还有一点,你调完补偿之后,要根据FMO来设置阴性门,是不是CD45RA的阴性门根据CD8阳性调下来之后的那群来设阴性门会比较好
你调补偿时,其他电压应该没动吧
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发表于 2016-3-21 20:15:20 | 显示全部楼层
shinian 发表于 2016-3-21 14:53
补偿值调节的过程拍了一组照片

奇怪,你这是什么机器?这款软件从来没见过。

从问题中,我明白你想问的关键之处在于调节补偿后为什么CD45RA阳性率与单染时不一样。这其实涉及到门的设置,因为在你这个标本里面CD45RA分群并不好,所以你单染时根据直方图设置的门是否正确需要考量(还有,你叠加的阴性峰是什么标本?)。另一方面,从你后面的描述看,补偿是否调节到位你根本没有理解,我给你的帖子你根本没有仔细读就说跟你理解的一样,所以过度补偿,也是会影响此比例的。

如何调节正确的补偿,此处我暂时不说,给你留个作业
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 楼主| 发表于 2016-3-22 18:44:07 | 显示全部楼层
小橘灯 发表于 2016-3-21 17:57
从图上看,看不到阴性群。调补偿应该是,同一群细胞,有阳性的,有阴性的;根据阴性的,把阳性PE溢漏到PERC ...

图二是CD8-PE,可以看到阳性80%以上,阴性的感觉已经在在坐标轴之外去了,不在阴性对照那个峰的位置,但是我的电压值没有改变过。

恩,下次试试增加FMO来做CD45RA的阴性对照看看。
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 楼主| 发表于 2016-3-22 20:35:24 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-3-21 20:15
奇怪,你这是什么机器?这款软件从来没见过。

从问题中,我明白你想问的关键之处在于调节补偿后为什么CD ...

用的millipore的guava easycyte流式仪和软件。

如果要按照对比MFI值来确定补偿的话,我画了下图里面R14的门然后调整补偿值,使CD8-PE单染管的PerCP通道R14门内MFI值和isotype管R14门内MFI值大概差不多,得到的是这么个结果,这个看起来也还是不对啊。逐渐调高补偿值得过程当中,并不是整个峰逐渐左移,而是很多信号就直接被压到坐标轴外了,就是最左边那细长的一条,所以看起来好像整个峰信号比阴性对照明显要强,但是加上最左边那些信号一起得出的MFI值这个时候是和阴性对照差不多的。 QQ图片20160322202346.jpg

单染管直方图是根据isotype阴性对照抗体染同样的细胞设定的门,我觉得起码CD45RA单染结果应该是准确的吧?



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发表于 2016-3-22 21:52:59 | 显示全部楼层
shinian 发表于 2016-3-22 20:35
用的millipore的guava easycyte流式仪和软件。

如果要按照对比MFI值来确定补偿的话,我画了下图里面R14的 ...

分群不清楚的话,单染亦未必是准确的。
我的建议是你把原始数据导出为FCS文件传上来,我们看了之后再讨论哪个准确,你觉得呢?
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 楼主| 发表于 2016-3-23 15:06:11 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-3-22 21:52
分群不清楚的话,单染亦未必是准确的。
我的建议是你把原始数据导出为FCS文件传上来,我们看了之后再讨论 ...

好的 晚一点我把文件上传  谢谢啦
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 楼主| 发表于 2016-3-24 16:16:08 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-3-22 21:52
分群不清楚的话,单染亦未必是准确的。
我的建议是你把原始数据导出为FCS文件传上来,我们看了之后再讨论 ...

6个fcs文件,包括一个isotype对照,四个单染,一个四色
请大家指点一下,多谢多谢

shinian20160318.rar

2.15 MB, 下载次数: 9

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发表于 2016-3-30 10:30:25 | 显示全部楼层
所以说,有些学生做试验,能单染的,我都建议他们单染。
不能单染的,最好的办法就是跨度比较的颜色应用。

补偿永远是流式细胞仪最不好整的东西。

越多色越难整。
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