R语言的flowCore包画出来的流式图很朦胧

niwanmao · 发表于 2012-10-6 07:18:32

素年锦时323 发表于 2012-10-6 07:09:28

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一点点拙见

感谢分享:-)
不过这些package都是可以通过我在顶楼帖中source……biocLite加包的名称安装

素年锦时323 · 发表于 2012-10-8 07:57:18

niwanmao 发表于 2012-10-5 17:18

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感谢分享:-)
不过这些package都是可以通过我在顶楼帖中source……biocLite加包的名称安装 ...

非常感谢，现在可以用了。

niwanmao · 发表于 2013-5-20 13:50:48

看来得好好学习一下R了。这工具一下子同时画出各种组合散点图，省得我们自己画了。

只是目前还不知道如何能够修改上面的FL1-H等名称为标记的名称

plot matrix

haven_t · 发表于 2013-5-20 17:05:36

niwanmao 发表于 2013-5-20 13:50

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看来得好好学习一下R了。这工具一下子同时画出各种组合散点图，省得我们自己画了。
只是目前还不知道 ...

其实CFCS前几次更新就已经实现了这个功能，不过只有左上部分，右下部分其实是左上的坐标转致，感觉是重复的，所以没有提供。

niwanmao · 发表于 2013-5-20 18:27:17

haven_t 发表于 2013-5-20 17:05

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其实CFCS前几次更新就已经实现了这个功能，不过只有左上部分，右下部分其实是左上的坐标转致，感觉是重复 ...

啊？CFCS有了？怎么操作，教一下吧：）

haven_t · 发表于 2013-5-20 19:51:27

本帖最后由 haven_t 于 2013-5-20 19:53 编辑

niwanmao 发表于 2013-5-20 18:27

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啊？CFCS有了？怎么操作，教一下吧：）

4月29日更新有说明，在数据列表右键有Add muti plot，然后选择门和所需要的所有参数即可在Pilot处生成多个Plot，这也是我要用Pilot的一个原因，否则很难确定图形在何处生成，特别是页面的图很多的时候。
捕获_1~1.JPG

niwanmao · 发表于 2013-5-20 20:19:47

haven_t 发表于 2013-5-20 19:51

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4月29日更新有说明，在数据列表右键有Add muti plot，然后选择门和所需要的所有参数即可在Pilot处生成多 ...

确实可以。但是能否象他们那样组成一个matrix样的大图，那比较美观比较容易查看。

haven_t · 发表于 2013-5-20 21:52:06

niwanmao 发表于 2013-5-20 20:19

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确实可以。但是能否象他们那样组成一个matrix样的大图，那比较美观比较容易查看。 ...

考虑过这样做，就是觉得很难排版，如果参数太多，Plot很容易超出页面，这时候要重新排列更麻烦。

niwanmao · 发表于 2013-5-20 22:49:53

haven_t 发表于 2013-05-20 21:52:06

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考虑过这样做，就是觉得很难排版，如果参数太多，Plot很容易超出页面，这时候要重新排列更麻烦。

flowing这个软件去年出的新版本还是比较有意思的，它分析像你的软件那样随意拖放，但是它另外有一个叫imagecollection的控件，在你切换数据时，自动将相关图形添加到这个控件中自动排版，很适合批量处理。你可以看看。

haven_t · 发表于 2013-5-21 14:22:17

niwanmao 发表于 2013-5-20 22:49

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flowing这个软件去年出的新版本还是比较有意思的，它分析像你的软件那样随意拖放，但是它另外有一个叫imag ...

一张A4纵向排版，一行就大概只能放4~5个图，如果4色的机器，把物理参数算上的话就没法按矩阵的方式排版了。

image collection的功能和我原来设想的表格功能很象，也非常直观，不过真正实际操作起来就是另一回事，您试一下用来分析一个免疫分型，然后用来发报告就会感觉到了。

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