关于抗原在样本表达是否连续的问题

火星海

在收到倪老师指点之后我自己重新回去与ai学习之后得出以下结论以此恳请老师继续指点：首先对于“该抗原在细胞上的正常表达模式究竟是连续性还是分群明显的那种”，我的理解是可以在画门条件相同的情况下，例如都在FSC、SSC选取主要细胞群、并选取主要单个细胞群之后看相关指标的单染管是否分群明显以此来进行界定，但这种方法好像仅仅适用于处于上游的指标。如果我需要看CD11b、F4/80双阳细胞群里，CD74是否连续或分群明显，则是不是需要更进一步的准备一个活死染、CD11b、F4/80的管呢？是否为必须步骤？恳请老师指点，

niwanmao

F4/80和CD11b分群都是很好的，设门不成问题

CD74我看这篇Nature上的文献，在CD4+T中分群还是不错的：https://www.nature.com/articles/s41467-024-47981-3

如果你真的遇到那种连续表达分不清楚的，首选生物学阴性的细胞作为设门参照。如果找不到，那就做一个 FMO 对照。

火星海

niwanmao 发表于 2026-1-13 10:20
F4/80和CD11b分群都是很好的，设门不成问题

CD74我看这篇Nature上的文献，在CD4+T中分群还是不错的：https ...

好的非常感谢老师

Yuck

逻辑画门的两重方式：以群滑门和以对照画门。如果是分群明显首选以群画门；如果是分群不明显那就是首选以生物学对照画门，次选FMO画门。
那就返回来为什么说有些指标是连续指标，就是因为 检测结果是通过以群画门画不出来了所以才选择说这个是连续指标（当然这个指标有可能是细胞本身就是随机表达，有可能是仪器本身灵敏度分辨率不高无法分群等等）。
那这样就是如果想说某个指标（cd74）是不是连续指标，最合理的就是把他的上级（活死染、CD11b、F4/80等等以群画门都表征了）确认了分不了群，再分析到某个次级门指标是否是连续。
接着就说到后面的必需做不做的问题，就跟你实验目的相关了。你是否是需要回算到FSC主细胞群后的CD47细胞结果呢，如果是回算回去，觉得其实没必要做混染？还是需要的是排除其他非目的细胞或富集细胞（活死染、CD11b、F4/80等等)的CD47细胞的报告值呢？