求帮忙使用Modfit分析细胞周期

gcz5340

niwanmao 发表于 2011-12-16 11:37

                               
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感谢你对我们工作的配合。以下是您的数据结果：

倪老师，我注意到你这个modfit版本应该是3.2版本的，这个1.90是你人为设的了吗？我想问一下，你这个设有什么技巧吗，是逐个的试看哪个RCS好？我有周期样本我试过2.0、1.98、1.96、1.94、1.92，RCS差别蛮多，G2和S期的比例也有变化。

niwanmao

gcz5340 发表于 2012-5-9 21:46

                               
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倪老师，我注意到你这个modfit版本应该是3.2版本的，这个1.90是你人为设的了吗？我想问一下，你这个设有 ...

是的，我调节这个数值有点主观性，反复调整至肉眼看曲线拟合很漂亮，同时rcs值也在允许范围内即可。

gcz5340

niwanmao 发表于 2012-5-9 22:04

                               
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是的，我调节这个数值有点主观性，反复调整至肉眼看曲线拟合很漂亮，同时rcs值也在允许范围内即可。 ...

是啊，搞不懂新版本为什么改成这样。

niwanmao

gcz5340 发表于 2012-5-9 22:08

                               
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是啊，搞不懂新版本为什么改成这样。

老版本调整了这个数字都没用的，有时候碰到一些不好的结果很难拟合的，我觉得新版本这样更方便拟合了。只要拟合的好，百分比应该相差不大啊

赖浩强

分析的好漂亮啊，但是我分析的模拟出来的曲线还是不平滑，好差，难看。

niwanmao

赖浩强 发表于 2012-10-8 19:15

                               
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分析的好漂亮啊，但是我分析的模拟出来的曲线还是不平滑，好差，难看。

有些峰比较明显的数据，基本上软件能够自动找到峰，拟合的自然很漂亮。
而如果一些不明显的峰，就需要靠对这类细胞的特性了解，不断进行微调，同时观察RCS和CV等数值，直至获得理想数据拟合曲线。
慢慢来，你肯定可以做到的。

赖浩强

那老师，我的是正常细胞。每次分析的时候cell跟%cv都是poor，就算那我把全部细胞都圈进去cell还是一样显示poor，只有九千多.还有就是那个linearity对于正常细胞来说是选多大的范围呢？谢谢老师了~~

niwanmao

赖浩强 发表于 2012-10-9 10:09:46

                               
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那老师，我的是正常细胞。每次分析的时候cell跟%cv都是poor，就算那我把全部细胞都圈进去cell还是一样显示poor，只有九千多.还有就是那个linearity对于正常细胞来说是选多大的范围呢？

linearity这个指标我还真没有注意到。rcs和cv比较重要。9000个细胞是太少了，一般至少2万以上。

如有可能，建议上传你的数据，我们看看