细胞周期ModFit分析

vetzcm

ddn111 发表于 2012-3-26 22:18

                               
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找数据搞上来吧！设定左边那一条单个细胞门，收10000就行了！

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这是我的数据，您可以帮我分析一下吗？谢谢！

niwanmao

ddn111 发表于 2012-3-26 22:04

                               
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看你的图中，Ｇ２/Ｇ１用2.0有点不合适，拟合不好的话ＲＣＳ比较高！

嗯，这是个问题，3.1版g2/g1设置好比例之后会严格按照该比例分析，的确会影响rcs值。不过在旧版设置效果不明显，不知道vetzcm用的是那个版本？
a/w图的门也很重要。

ddn111

你的第一个文件！大约是这样，细胞数少了点！ＣＶ和ＲＣＳ都ＯＫ！

ddn111

你的给药组！

vetzcm

niwanmao 发表于 2012-3-26 22:30

                               
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嗯，这是个问题，3.1版g2/g1设置好比例之后会严格按照该比例分析，的确会影响rcs值。不过在旧版设置效果 ...

我用的3.2版本的...

vetzcm

ddn111 发表于 2012-3-26 22:36

                               
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你的给药组！

感觉你分析的结果很好啊，我这才意识到，我们之前分析的数据存在不少问题，太过于追求G2/G1的值偏大了，总以为1.9以上会好些，还有就是我们之前那个门圈的可能也不是很好，真的很感谢ddn111的帮助！细胞数少的问题一方面是我上次收的细胞数太少了 不知ddn111您发现没，我CK组中的Aggregates 6.06%，看来细胞处理时我没分散好细胞啊！Debris7.31%不知可否接受啊...

niwanmao

vetzcm 发表于 2012-3-26 22:53

                               
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我用的3.2版本的...

3.2是可以设置G2/G1比例，并且拟合时严格根据该比例进行拟合。

vetzcm

niwanmao 发表于 2012-3-27 09:47

                               
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3.2是可以设置G2/G1比例，并且拟合时严格根据该比例进行拟合。

是不是在分析时，我们不能过于关注G2/G1值越接近2.0越好，应根据Diagnostics 的那6个参数来评价结果的可信度啊？其中的RCS是不是应首先满足要求，然后其他参数只要不是Poor就可以接受结果。还有同一批处理的各个样品间的G2/G1值是不是可以不一致呢？

niwanmao

vetzcm 发表于 2012-3-27 22:51

                               
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是不是在分析时，我们不能过于关注G2/G1值越接近2.0越好，应根据Diagnostics 的那6个参数来评价结果的可 ...

其实我觉得在取的时候就得注意，尽可能使G2峰和G1峰的比值接近2，这样分析的时候可以省去改动这些默认值了。

取的时候尽可能使该比值接近2，我认为对一些异倍体峰的判断也更有帮助。供参考.

蓝白小熊

ddn111 发表于 2012-3-26 22:18

                               
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找数据搞上来吧！设定左边那一条单个细胞门，收10000就行了！

周期一般不是要30000个细胞吗，这样才比较准备吧