提前适应diva中

niwanmao · 发表于 2012-10-23 13:53:51

最近发现，DIVA导入数据时，是根据SAMPLEID自动归类建立tube目录的，于是在calibur上获取数据时，每个患者都输入其sample id，导入时轻松了很多。
现在用了一段时间，感觉各有优缺点，不知道有没有软件能够综合他们的优点：
1、DIVA门的缩放一定要按住SHIFT键，还是不如CALIBUR直接以4个点来进行缩放方便；
2、至于模板方面，DIVA同一数据不同模板之间切换比较方便，但不能单独保存某个病人的分析模板，所以不利于日后调出重新查看，而CELLQUEST则是同一模板不同数据之间切换比较方便，而且能单独保存某病人自己独有的分析模板，日后重新查看，或者进行残留病灶监测就方便多了。

haven_t · 发表于 2012-10-23 17:14:42

niwanmao 发表于 2012-10-23 13:53

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最近发现，DIVA导入数据时，是根据SAMPLEID自动归类建立tube目录的，于是在calibur上获取数据时，每个患者 ...

在nomal worksheet下就是独立的分析模板。

niwanmao · 发表于 2012-10-23 18:43:34

haven_t 发表于 2012-10-23 17:14:42

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在nomal worksheet下就是独立的分析模板。

哦。diva导入的数据或者直接获取的数据是不是都保存在数据库里面？那样数据库会不会太大？

haven_t · 发表于 2012-10-24 12:06:28

用多了你对里面的数据组织会有体会的，可以一个个specimen对应一个病人，然后建立多个sheet都应每个病人，或者每个病人用一个experiment都可以。越用越慢是肯定的，看看D盘里面.db .log的文件就知道，我即使删除数据这两个文件都不会缩小。

niwanmao · 发表于 2012-10-24 12:52:45

haven_t 发表于 2012-10-24 12:06

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用多了你对里面的数据组织会有体会的，可以一个个specimen对应一个病人，然后建立多个sheet都应每个病人， ...

mysql、sqlite等数据库都有个清空碎片的功能，估计diva没有把数据库的清空冗余空间功能做到软件里面，不知道diva用的是什么类型的数据库，到时候看看。

每个病人一个sheet我早上试了下，可以，就是取消global sheet状态，就会自动建立一个新的sheet，这个应该是private的，然后apply analysis template就出现了，但我想找保存按钮就是找不到，后来才想通，可能所有的东西就是已经保存在experiment了。这样还是不方便，如果我一天50个病人，打开50个sheet，又不能关闭，这个tab栏不是乱的要命？

niwanmao · 发表于 2012-11-6 14:57:06

发现diva和cellquest的坐标不一样啊，怎么回事？ @haven_t

diva

cellquest

haven_t · 发表于 2012-11-6 22:31:27

niwanmao 发表于 2012-11-6 14:57

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发现diva和cellquest的坐标不一样啊，怎么回事？ @haven_t

没有试过导入低版本的数据，看来Diva对早期数据兼容还是有点问题的，试一下在Experiment的Inspector中选5 Decade看看如何，不过这些小细节一般不影响分析结果，除非要统计荧光强度。

niwanmao · 发表于 2012-11-6 22:37:03

haven_t 发表于 2012-11-6 22:31

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没有试过导入低版本的数据，看来Diva对早期数据兼容还是有点问题的，试一下在Experiment的Inspector中选5 ...

下午用手机上传的时候发现没排好次序，现已排好。

可能是对导入的FCS文件数据转换的缘故吧？而且从上面的对比中看出，cellquest从10E0开始，而diva似乎不是，所以造成我在分析残留时，有时候位置很难确定。

haven_t · 发表于 2012-11-7 17:32:56

niwanmao 发表于 2012-11-6 22:37

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下午用手机上传的时候发现没排好次序，现已排好。

可能是对导入的FCS文件数据转换的缘故吧？而且从上面 ...

导入后是否每次都重新开始作图设门？倪兄有么有什么好的办法？

niwanmao · 发表于 2012-11-7 20:24:49

haven_t 发表于 2012-11-7 17:32

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导入后是否每次都重新开始作图设门？倪兄有么有什么好的办法？

导入后不需要重新作图设门的啊，我一直用global worksheet，没有针对每个病人变成单独的sheet。

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