请问要检测DNA含量需要用什么软件进行分析呢？谢谢了

niwanmao

zml 发表于 2012-12-18 22:46

                               
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还是这样发吧

看得见的信号很少

看得见的信号很少

坐标轴外面的信号很多

坐标轴外面的信号很多

因此，建议你下次获取时，不要调整阈值了，重点放在电压上，调高电压试试！！！尤其是FL3要设置为LOG模式

zml

niwanmao 发表于 2012-12-18 22:54

                               
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看得见的信号很少

好的，谢谢老师了·实在是麻烦了呀·

didi_zhou

niwanmao 发表于 2012-12-18 22:54

                               
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看得见的信号很少

检测周期为什么要用Log？

didi_zhou

zml 发表于 2012-12-18 19:23

                               
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老师，我想请教一个问题。我是用的Beckman培训的时候检查DNA的方案。但是检测的是细菌，在最初的时候我用 ...

调节阈值同时会改变触发通道，你可以先把阈值设回到FS，稍微降低，20〜30，然后使用FS与SS的log信号作图寻找目的群落（因为细菌相对偏小，且不一定呈圆形，所以用log信号，然后主要调节电压，不要经常动阈值）。FS，SS，FL3的电压可能都会较大。从图上看，结果可能有两种情况造成，一是没找到目的细胞，二是前处理不当，细菌全部碎裂只有碎片。
另外如果要使用FL3做triger也是可以的，但也是调节电压为主，如果电压调节变化不明显多半是因为没有完整细胞造成的，就是说基本都是碎片。

zml

didi_zhou 发表于 2013-1-8 02:20

                               
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调节阈值同时会改变触发通道，你可以先把阈值设回到FS，稍微降低，20〜30，然后使用FS与SS的log信号作图 ...

老师，您好，今天我按您的建议重新弄了一下，是将阈值先设置FS为30后确定了细菌的大致位置，然后在又设置在FL3位置为相同的阈值，FS/SS是用的LOG图形，各项的参数为：FS:电压72.增益2.0；SS：电压576，增益10.0；FL3为电压654，增益2.0；AUX电压164，增益2.0.但是觉得结果的周期不明显，请问是不是应该把FL3的值加大呢？附件是，我这次做的LMD文件和FLOWJO画的图，还麻烦老师帮忙指点一下，谢谢了·（其中参数设置图，为设置参数后保存的图，样品图为用设置好的参数，检测另一样品的图）

zml

各位老师好，这是我做的一种细菌的DNA倍体的流式实验。方法是将阈值先设置FS为30后确定了细菌的大致位置，然后在又设置在FL3位置为相同的阈值，FS/SS是用的LOG图形，各项的参数为：FS:电压72.增益2.0；SS：电压576，增益10.0；FL3为电压654，增益2.0；AUX电压164，增益2.0.但是用FLOWJO觉得结果的周期不明显，而且用MODIFIT感觉出不来图形，因为课题组就我一个人在做这个实验，无法判断怎样才算是最好的结果。从上看感觉似乎都没有形成两个峰值，所以想请教下是不是应该把FL3的值加大呢或者是细菌的前处理就存在很大的问题呢？附件是，我这次做的LMD文件和FLOWJO画的图，还麻烦各位老师帮忙指点一下，谢谢了·（其中参数设置图，为设置参数后保存的图，样品图为用设置好的参数，检测另一样品的图）

niwanmao

zml 发表于 2013-1-9 17:12

                               
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各位老师好，这是我做的一种细菌的DNA倍体的流式实验。方法是将阈值先设置FS为30后确定了细菌的大致位置， ...

由于在fsc/ssc log时信号能够到中间区域，那说明这类信号应该不是碎片，但是我觉得你的AUX电压是否还可以再稍微调高点。

由于是COULTER的机器，不是很熟悉，所以细菌的周期分析起来我也不是很有底气，大概的分析结果如下,由于后面的拖尾很长，所以RCS和CV都很大，结果拟合的确实不理想（图片名称就是对应的文件名），供参考，可以请其它站友出来一起鉴定一下  @didi_zhou

  

zml

niwanmao 发表于 2013-1-9 22:52

                               
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由于在fsc/ssc log时信号能够到中间区域，那说明这类信号应该不是碎片，但是我觉得你的AUX电压是否还可以 ...

谢谢老师，我再调节下AUX和FL3的电压看看·

兔子赵

很早之前帮人做过一种细菌，结果跟你差不多。
记得它跟普通的细胞周期不太一样，好像是分2个时期，与我们普通流式做的细胞周期是2回事。
具体是哪种细菌我也不记得了。如果跟正常有丝分裂不太一样，我个人觉得拿流式做周期的意义不是很大

niwanmao

兔子赵 发表于 2013-1-17 17:56

                               
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很早之前帮人做过一种细菌，结果跟你差不多。
记得它跟普通的细胞周期不太一样，好像是分2个时期，与我们普 ...

@兔子赵 倒是说到要点了，我前面也忽略了这一点，确实，我们要分析周期，首先得了解这种研究目标的本身周期特点，例如它是几倍体？有几个周期？是否有参照？  @zml 可以先查查相关资料看，你所研究的细菌其它研究学者应该也研究过，他们做出来的周期是怎么样的，然后你再回头分析，就心里有数了。