PI单染测凋亡

niwanmao · 发表于 2013-4-18 12:33:06

mayi009 发表于 2013-4-18 12:15

登录/注册后可看大图

如果是只分析周期当然好画门，问题是FL2-A/FL2-W下端那一团是细胞还是碎片？它在R1门内，应该大部分是细胞 ...

如果是我，我肯定不圈。肯定是碎片。

mayi009 · 发表于 2013-8-8 11:20:33

呵呵，好久没上来了，论坛还是那么热闹！

又有问题需要骚扰一下老师，还是PI单染测凋亡的问题，对于G1偏态峰分析凋亡我一直分析不好。附件里文件1是对照组，2,3是样本组，软件自动分析样本组都有20%左右的凋亡率，感觉分析结果偏高了，但手动分析也分析不好，感觉对modfit还是不太会使用。麻烦老师帮忙分析一下，再次请教了！

niwanmao · 发表于 2013-8-8 21:10:38

mayi009 发表于 2013-8-8 11:20

登录/注册后可看大图

呵呵，好久没上来了，论坛还是那么热闹！

又有问题需要骚扰一下老师，还是PI单染测凋亡的问题，对于G1偏态 ...

我用Modfit 3.1版本手工拟合也是始终拟合不好，因为这个subG1峰跟G1靠的很近，而且只是一个斜肩峰，所以modfit拟合时就将很大一部分G1峰算到subG1了，结果明显偏大。不知道新版本3.3有没有解决此问题。

不过flowjo的拟合似乎没这个问题，不受斜肩峰影响，结果如下：

mayi009 · 发表于 2013-8-9 15:42:32

我用的是Modfit 3.2版本，手上没有flowjo，所以没试过，原来flowjo还可以分析周期。flowjo没有给出sub-G1峰型，只出数据？super-G2是什么？

niwanmao · 发表于 2013-8-9 19:06:13

mayi009 发表于 2013-8-9 15:42

登录/注册后可看大图

我用的是Modfit 3.2版本，手上没有flowjo，所以没试过，原来flowjo还可以分析周期。flowjo没有给出sub-G1峰 ...

以下解释是flowjo中文博客中的说明：
FlowJo 分析细胞周期时候，用S,G1, G2 去模拟周期，对于G1之前，G2之后的笼统用Sub-G1或者Super-G2来统计，给出一个百分比。FlowJo只给出sub-G1的百分比，从严格意义上来讲，并不能分析细胞凋亡。sub-G1其实很可能就是凋亡细胞，但是从科学理论来讲的话，用户还是需要对细胞染专门的凋亡marker，然后再用FlowJo来分析凋亡细胞。细胞周期平台对于凋亡细胞的分析来说并不是一个合适的工具。

didi_zhou · 发表于 2013-8-13 15:41:56

mayi009 发表于 2013-8-8 11:20

登录/注册后可看大图

呵呵，好久没上来了，论坛还是那么热闹！

又有问题需要骚扰一下老师，还是PI单染测凋亡的问题，对于G1偏态 ...

看看能不能用。

niwanmao · 发表于 2013-8-13 19:43:39

didi_zhou 发表于 2013-8-13 15:41

登录/注册后可看大图

看看能不能用。

这个是用multicycle吧？那软件我还真不会用，每次选择这选择那的，到最后很多按钮都变灰了。

didi_zhou · 发表于 2013-8-13 22:44:08

niwanmao 发表于 2013-8-13 19:43

登录/注册后可看大图

这个是用multicycle吧？那软件我还真不会用，每次选择这选择那的，到最后很多按钮都变灰了。 ...

我也是今天才会用的

，BC的机器可以直接另存为.HST直方图文件，打开就自动拟合。

niwanmao · 发表于 2013-8-13 23:02:53

didi_zhou 发表于 2013-8-13 22:44

登录/注册后可看大图

我也是今天才会用的，BC的机器可以直接另存为.HST直方图文件，打开就自动拟合。 ...

普通的FCS文件拟合步骤你懂么？教一下吧：）

didi_zhou · 发表于 2013-8-13 23:29:20

niwanmao 发表于 2013-8-13 23:02

登录/注册后可看大图

普通的FCS文件拟合步骤你懂么？教一下吧：）

这个就是直接用的FCS文件弄的啊。

我去截几张图先，您等等。

账号		自动登录	找回密码
密码			加入流式中文网

[凋亡检测] PI单染测凋亡

评分