请问ROS结果如何分析

sherry123

这是我一次实验中检测ROS的图，呈不连续性双峰分布，分析结果时是应该计算总体的Geom Mean或者Mean，还是需要设双分门，计算阳性区域的比例，或是计算阳性区域的Geom Mean或者Mean？

niwanmao

sherry123 发表于 2013-7-16 22:46

                               
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哦，您的图中SS INT就是指一般的SSC，就是做个FL1-SSC的图是吗？

SSC INT就是ssc，这是分析软件给加上去的后缀。不用管它。
就是象@didi_zhou  这样设门即可。

sherry123

那这样设门后，还是不懂，应该计算阳性区域的比例，还是计算阳性区域的Geom Mean或者Mean？

niwanmao

sherry123 发表于 2013-8-28 17:58

                               
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那这样设门后，还是不懂，应该计算阳性区域的比例，还是计算阳性区域的Geom Mean或者Mean？ ...

用＠didi_zhou  提示的FL1/SSC散点图设门圈出阳性细胞，然后看其比例。你可以把你上面的数据用这种散点图的方式设门看看，如果不会设，可以传上来.

sherry123

请您帮忙做这张图，不知怎么分析？

niwanmao

sherry123 发表于 2013-8-28 22:11

                               
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请您帮忙做这张图，不知怎么分析？

如下设门：

sherry123

好的，谢谢您！有两个问题：1、不需要先在FSC-SSC上设门排除碎片吗？2、您的意思是直接用第二张图的百分比进行分析吗？那这样与用DCF柱状图阳性区域的Geom Mean或Mean相比，哪种分析方法更可靠？

niwanmao

sherry123 发表于 2013-8-29 09:04

                               
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好的，谢谢您！有两个问题：1、不需要先在FSC-SSC上设门排除碎片吗？2、您的意思是直接用第二张图的百分比 ...

你可能没仔细看我图上写的字，因为我不知道你要分析淋巴细胞还是粒、单核细胞，所以未设门，你可以按照自己的实验目的，圈相应的细胞，自然也就把碎片排除掉了。
至于比较，我认为能够分群的，最好用百分比，除非百分比体现不出差异或无法分群，才会去比较MFI。

sherry123

这是用细胞株做的实验；原来在流式柱状图中，百分比要优先于MFI，原本还以为相对于双染的散点图，单染的柱状图的分析最好都用MFI；另外，在一组实验中，比如有正常对照组、模型组、几个处理因素组，有的分群明显，有的不明显，如下图，还是用百分比好些吗？

niwanmao

sherry123 发表于 2013-8-29 09:34

                               
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这是用细胞株做的实验；原来在流式柱状图中，百分比要优先于MFI，原本还以为相对于双染的散点图，单染的柱 ...

你把上面两个直方图上看起来分群不清楚的，都改成FL1/SSC显示，肯定分群就清楚了。
如果你用的都是细胞株，那么设门就圈那群主要的细胞即可。