modfit中的apoptosis model 分析

燕仔zoe

niwanmao 发表于 2014-12-11 18:59
原始数据能不能传上来看看？

好的，谢谢倪老师
对照组是control
实验组随便挑了一个，编号004

燕仔zoe

haven_t 发表于 2014-12-12 07:48
试一下阈值用PI的通道。

阈值如果用PI的通道的话，相当于把PI弱阳性的给删掉，但是这些在我的FSC/SSC图中其实是比较靠近主细胞群的那一类，如果按照这种阈值设置方式，会不会把一些本来是数据的点给去掉了啊？

燕仔zoe

(⊙o⊙)哦，实在是太感谢倪老师了！！！
艾森的novoexpress软件我没有，FlowJo倒是我以后可以试试~
不知道为什么modfit的FSC/SSC图会和其他两个分析软件相差有点大呢？

niwanmao

燕仔zoe 发表于 2014-12-15 08:25
(⊙o⊙)哦，实在是太感谢倪老师了！！！
艾森的novoexpress软件我没有，FlowJo倒是我以后可以试试~
不知道 ...

这种情况应该还是少见的。多数情况下还是应该以modfit为准的。

haven_t

燕仔zoe 发表于 2014-12-12 13:16
阈值如果用PI的通道的话，相当于把PI弱阳性的给删掉，但是这些在我的FSC/SSC图中其实是比较靠近主细胞群 ...

你想太多了，如果主峰是2倍体，PI dim的那群DNA含量可能连1倍体的量都不到，个人觉得那群细胞可能是处理过程中部分核被切割掉。
从倪老师的分析结果看到，通过FSC/SSC 设门完全把PI dim的群体去掉，因此可以说明如果用pi做阈值可以达到同样的效果。相反你这样获取细胞的话反而使可分析的细胞数减少。