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补偿超过100是否合理?

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发表于 2016-8-10 20:56:31 | 显示全部楼层 |阅读模式

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haven_t 站友在帖子(http://www.flowcyto.cn/bbs/forum.php?mod=viewthread&tid=5323)中提到:
前些日子跟人去flow core分选,发现那个老外把一个通道补偿调到120,我和她争辩了几句,她总觉得这个只是叠加的系数。而我觉得在合理电压下,如果漏出通道比检测通道检测到的信号还要高,那不如直接在溢出通道检测算了。而且在超过50%的补偿会造成群体离散严重,反正我是觉得不合理的,大家讨论一下。

这个问题确实有点意思,于是整理了点资料,在此与大家分享。
这里其实涉及到溢出矩阵(Spillover Matrix)和补偿矩阵(Compensation Matrix)的区别。
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发表于 2016-8-11 02:38:28 | 显示全部楼层
1.取 反的说法有点怪,应该是用取逆。
简单来讲,就是矩阵A表示溢出,取逆B表示补偿,其中AB=E,E为单位矩阵。

2.我曾经在Cytometry@lists.purdue.edu 上问过类似的问题,有十几个回复。
总结他们提到的面对这种问题的解决方案:
a.单染管样品有没有搞错,搞混。
b.仪器的此通道的质检报告
c.PMT的设置按"2.5 X S.Den"原则
d.因为我所用的为BV系列的抗体,有推荐用BD出品的BV染料染色buffer.
e.要换相对应的通道滤光片

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 楼主| 发表于 2016-8-11 08:11:31 | 显示全部楼层
hbezyr 发表于 2016-8-11 02:38
1.取 反的说法有点怪,应该是用取逆。
简单来讲,就是矩阵A表示溢出,取逆B表示补偿,其中AB=E,E为单位矩阵 ...

1、取逆 没听说过,编程上常规术语是取反:http://baike.baidu.com/view/11757812.htm,中文用词博大精深:)

2、确实需要多方面考虑,感谢您分享如此非常完善的方案  
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发表于 2016-8-11 10:31:58 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-8-11 08:11
1、取逆 没听说过,编程上常规术语是取反:http://baike.baidu.com/view/11757812.htm,中文用词博大精深 ...

北大线性代数的术语是求逆矩阵。
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发表于 2016-8-11 10:38:36 | 显示全部楼层
就线代而言,矩阵的元素可以为任何数,包括实数甚至是虚数,但在这些情况下大于100%不合逻辑,虽然仍然可以这样做,也可以得到结果,但是我会质疑准确性。
其实真的有一种情况,就是荧光强度太高,达到检测上限,这时自动补偿往往会过补偿。
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发表于 2016-8-11 13:28:51 | 显示全部楼层
互为可逆矩阵
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 楼主| 发表于 2016-8-11 19:21:19 | 显示全部楼层
haven_t 发表于 2016-8-11 10:38
就线代而言,矩阵的元素可以为任何数,包括实数甚至是虚数,但在这些情况下大于100%不合逻辑,虽然仍然可以 ...

这里面涉及到电压的优化:http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-5235-1-1.html,未优化的电压是可能导致这种特别高的补偿出现,但目前有人验证过,认为也是可以的。
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发表于 2016-8-11 20:46:10 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-8-11 19:21
这里面涉及到电压的优化:http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-5235-1-1.html,未优化的电压是可能导致这种 ...

电压改变是可以改变补偿,但不建议这样做,文章说的对,这样是无法改变离散趋势的。
可不可以其实是相对的,在图形上你看到离散的程度了和比例了,脾脏CD11b+群体比例明显比阴性低很多,所以在视觉上离散的不厉害,而Beads的离散就不一样了。这个当然主要是看溢出通道所检测的信号是否足够强,如果足够强或者直接是阴性的就无所谓,如果弱阳性我觉得影响会很大。其实FL1也可以检测PE,如果信号够强的话分群也很明显啊,但我们一般都不会这样做,因为有更好的选择,如果你别无选择的话就凑合着吧。
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 楼主| 发表于 2016-8-12 08:09:30 | 显示全部楼层
haven_t 发表于 2016-8-11 20:46
电压改变是可以改变补偿,但不建议这样做,文章说的对,这样是无法改变离散趋势的。
可不可以其实是相对 ...

我晚上想了下,觉得这篇文章中虽然测试>100的补偿是可以用,但如果从原理上来说,总归是说明溢出的面积>在本通道的面积,说明肯定多少有什么问题在里面,可能是串联染料发生了降解,也可能是通道选择等问题。说到底,尽量不用这种>100的补偿方案,多少会有点问题在里面。
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发表于 2016-8-15 16:32:06 | 显示全部楼层
hbezyr 发表于 2016-8-11 02:38
1.取 反的说法有点怪,应该是用取逆。
简单来讲,就是矩阵A表示溢出,取逆B表示补偿,其中AB=E,E为单位矩阵 ...

您好,我想问一下什么是"2.5 X S.Den"原则?
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